More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2228 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 91 aa  188  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  92.22 
 
 		 92 aa  170  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  84.62 
 
 		 92 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  84.62 
 
 		 92 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  84.78 
 
 		 92 aa  164  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 		 92 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23061  30S ribosomal protein S19  83.52 
 
 		 91 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 		 92 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 		 91 aa  161  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0372  30S ribosomal protein S19  82.42 
 
 		 91 aa  160  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1959  30S ribosomal protein S19  80.22 
 
 		 91 aa  159  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1125  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 		 91 aa  155  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19991  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 		 91 aa  155  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.380662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16741  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 		 91 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17361  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 		 91 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1646  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 		 92 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 		 92 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17451  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 		 92 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 92 aa  150  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  75.28 
 
 		 94 aa  148  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  76.14 
 
 		 92 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  77.11 
 
 		 94 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 93 aa  147  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  74.71 
 
 		 91 aa  147  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 		 92 aa  147  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  75 
 
 		 92 aa  146  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  74.73 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  74.73 
 
 		 93 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 93 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  69.66 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 92 aa  144  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 92 aa  144  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 92 aa  144  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 92 aa  144  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 92 aa  144  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  72.53 
 
 		 93 aa  144  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 92 aa  144  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 92 aa  144  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 95 aa  144  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 92 aa  144  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 92 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 92 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 93 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 93 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 93 aa  143  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 93 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  77.11 
 
 		 94 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 92 aa  143  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 93 aa  143  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  78.31 
 
 		 94 aa  142  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  74.7 
 
 		 94 aa  142  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  73.49 
 
 		 94 aa  142  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 93 aa  142  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 93 aa  142  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 94 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  72.53 
 
 		 93 aa  141  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  71.76 
 
 		 95 aa  141  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 93 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 93 aa  141  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 93 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 93 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 93 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 93 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  74.16 
 
 		 92 aa  140  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 93 aa  141  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  74.16 
 
 		 92 aa  141  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 93 aa  140  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 93 aa  140  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  74.16 
 
 		 91 aa  140  6e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  74.16 
 
 		 92 aa  140  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 93 aa  140  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 92 aa  140  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  140  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  140  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 93 aa  140  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 93 aa  139  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 93 aa  139  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  73.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  71.08 
 
 		 94 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>