32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2064 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2064  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  129  9e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0330706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  80 
 
 		 50 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04401  putative high light inducible protein  78 
 
 		 50 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  75.51 
 
 		 50 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  68 
 
 		 50 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  68 
 
 		 50 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  62 
 
 		 50 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  62 
 
 		 50 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  62 
 
 		 50 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  62 
 
 		 50 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  50.94 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  50.94 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  51.85 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  50 
 
 		 56 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  47.92 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  47.06 
 
 		 56 aa  57  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  48.98 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  45.1 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  48 
 
 		 54 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  48.94 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  41.54 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1831  high light inducible protein  61.54 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0824  high light inducible protein  61.54 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  44.68 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  44.68 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  44.44 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00721  high light inducible protein  35.38 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.624875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  38.78 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  42.11 
 
 		 58 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  34.78 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  28.3 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  45 
 
 		 47 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>