20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0487 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1704  putative neutral invertase-like protein  80.25 
 
 
483 aa  837    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1847  putative neutral invertase-like protein  87.6 
 
 
485 aa  899    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.570169  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0487  putative neutral invertase-like protein  100 
 
 
485 aa  1005    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.782741  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0333  putative neutral invertase-like protein  72.86 
 
 
479 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03511  putative neutral invertase-like protein  72.23 
 
 
479 aa  746    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268956  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03591  putative neutral invertase-like protein  73.07 
 
 
479 aa  757    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.628204  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04191  putative neutral invertase-like protein  80.04 
 
 
483 aa  836    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21831  putative neutral invertase-like protein  80.87 
 
 
488 aa  828    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03531  putative neutral invertase-like protein  72.44 
 
 
479 aa  748    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03631  putative neutral invertase-like protein  78.33 
 
 
484 aa  822    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.072592  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0397  putative neutral invertase  45.23 
 
 
463 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2313  neutral invertase  35.91 
 
 
465 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0707  neutral invertase  36.31 
 
 
474 aa  306  7e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0609  neutral invertase  36.17 
 
 
483 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00065977  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0226  neutral invertase  37.5 
 
 
492 aa  297  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4707  neutral invertase  35.01 
 
 
482 aa  293  6e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2774  neutral invertase  38.29 
 
 
457 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01235  hypothetical protein  20.46 
 
 
389 aa  55.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2516  glycogen debranching enzyme-like protein  22.1 
 
 
445 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1828  glycogen debranching protein  21.83 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>