More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4701 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  100 
 
 
374 aa  754    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  80.61 
 
 
331 aa  529  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  68.69 
 
 
329 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  64.72 
 
 
326 aa  425  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3288  thiazole synthase  76.95 
 
 
270 aa  378  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2568  thiazole synthase  73.56 
 
 
268 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1269  thiazole synthase  69.65 
 
 
267 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0262061  hitchhiker  0.00290038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  59.7 
 
 
326 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  55.23 
 
 
347 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3503  thiazole biosynthesis family protein  66.02 
 
 
269 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  62.26 
 
 
267 aa  328  9e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3236  thiazole biosynthesis family protein  66.14 
 
 
264 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  63.67 
 
 
260 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0483  thiazole synthase  62.6 
 
 
256 aa  326  5e-88  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.525067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0653  thiazole synthase  64.09 
 
 
260 aa  326  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0614883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  63.14 
 
 
258 aa  326  5e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  63.32 
 
 
260 aa  322  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2464  thiazole biosynthesis family protein  64.59 
 
 
268 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2637  thiazole synthase  62.65 
 
 
259 aa  320  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0034  thiazole synthase  65.35 
 
 
262 aa  320  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  62.35 
 
 
260 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3861  thiazole synthase  62.99 
 
 
260 aa  314  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0385604  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02980  thiazole synthase  61.63 
 
 
264 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  62.7 
 
 
259 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0070  thiazole synthase  62.26 
 
 
264 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.496923  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1143  thiazole synthase  59.68 
 
 
263 aa  312  5.999999999999999e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2126  thiazole synthase  64.03 
 
 
262 aa  311  7.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4064  thiazole synthase  62.79 
 
 
261 aa  311  7.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554344  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0793  thiazole biosynthesis family protein  59.22 
 
 
260 aa  309  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.372773  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0643  thiamin biosynthesis protein ThiG  59.22 
 
 
260 aa  309  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.924132  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0224  thiazole synthase  63.04 
 
 
274 aa  308  6.999999999999999e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  61.81 
 
 
260 aa  308  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3190  thiazole biosynthesis family protein  59.39 
 
 
264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4167  thiazole synthase  60.31 
 
 
264 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.64186  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0248  thiazole synthase  62.26 
 
 
274 aa  306  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04980  thiazole synthase  62.26 
 
 
265 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01841  thiazole synthase  59.38 
 
 
264 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0480  thiazole synthase  61.87 
 
 
265 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1824  thiazole biosynthesis family protein  61.33 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0434  thiazole biosynthesis protein ThiG  61.09 
 
 
264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4740  thiazole synthase  61.09 
 
 
264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0361  thiazole synthase  59.53 
 
 
264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148225  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3146  thiazole synthase  61.48 
 
 
266 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711533  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5330  thiazole synthase  58.37 
 
 
264 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2061  thiazole synthase  58.37 
 
 
275 aa  296  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.864021  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1983  thiazole synthase  58.37 
 
 
275 aa  296  3e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1755  thiazole synthase  61.02 
 
 
256 aa  295  8e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0217  thiazole synthase  61.07 
 
 
259 aa  295  1e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5104  thiazole synthase  57.41 
 
 
270 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.433901  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4977  thiazole synthase  57.41 
 
 
270 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2399  thiazole synthase  60.16 
 
 
262 aa  294  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5154  thiazole synthase  57.41 
 
 
270 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.65179 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1839  thiazole synthase  60 
 
 
282 aa  293  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2164  thiazole biosynthesis family protein  57.03 
 
 
263 aa  291  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4104  thiazole biosynthesis family protein  57.65 
 
 
272 aa  287  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225759  decreased coverage  0.005774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1346  thiazole synthase  57.87 
 
 
257 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1335  thiazole synthase  57.09 
 
 
257 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0200731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2518  thiazole synthase  57.09 
 
 
257 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1433  thiazole synthase  57.09 
 
 
257 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  47.26 
 
 
327 aa  259  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1639  thiazole synthase  52.65 
 
 
277 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0613  thiazole synthase  53.28 
 
 
255 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0619  thiazole synthase  51.84 
 
 
256 aa  257  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2221  thiazole synthase  51.56 
 
 
279 aa  255  8e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0802  thiazole synthase  50.2 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0886  thiazole synthase  50.61 
 
 
256 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000535292  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  53.05 
 
 
666 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  53.05 
 
 
666 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0789  thiazole synthase  50.2 
 
 
256 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4542  thiazole synthase  50.2 
 
 
256 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0642  thiazole synthase  49.8 
 
 
258 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3633  thiazole biosynthesis family protein  53.23 
 
 
281 aa  252  8.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0698  thiazole synthase  49.8 
 
 
258 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0809  thiazole synthase  49.8 
 
 
256 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56378e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0732  thiazole synthase  49.8 
 
 
256 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0576  thiazole synthase  53.85 
 
 
286 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.0505529 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0642  thiazole synthase  49.39 
 
 
258 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1417  thiazole synthase  52.87 
 
 
255 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0648  thiazole synthase  49.8 
 
 
256 aa  249  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  51.34 
 
 
652 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  52.73 
 
 
291 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  54.33 
 
 
272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  50.57 
 
 
684 aa  243  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  47.01 
 
 
272 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  50 
 
 
265 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  51.37 
 
 
265 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  52.42 
 
 
256 aa  240  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  51.61 
 
 
259 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00531  thiazole synthase  50 
 
 
306 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  52.17 
 
 
281 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0914  thiazole biosynthesis family protein  51.38 
 
 
254 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1921  thiazole synthase  48.03 
 
 
267 aa  235  8e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5999  thiazole biosynthesis family protein  49.8 
 
 
296 aa  235  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2781  thiazole synthase  51.98 
 
 
252 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1663  thiazole synthase  49.61 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000271771  hitchhiker  0.00109923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  49.8 
 
 
267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  49.8 
 
 
269 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2225  thiazole biosynthesis family protein  48.43 
 
 
263 aa  232  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.797646  normal  0.127357 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  51.34 
 
 
652 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0987  thiazole synthase  50.2 
 
 
262 aa  232  9e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>