33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1029 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1029  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  293  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.0601496 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  30.43 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  31.88 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  33.66 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  31.16 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  31.16 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  31.16 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  31.16 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  31.16 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  31.16 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  28.17 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0601  hypothetical protein  32.52 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0427524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1056  hypothetical protein  32.52 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0967482  normal  0.03281 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0540  hypothetical protein  32.52 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  28.68 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1923  hypothetical protein  28.1 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  32.43 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  25.53 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  28.8 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  32.09 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  22.22 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  28.47 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  32.69 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  27.27 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  27.56 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  22.96 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2373  hypothetical protein  41.54 
 
 		 146 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  24.41 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13093  hypothetical protein  36.84 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.545898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  22.97 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00902  hypothetical protein  26.17 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  26 
 
 		 177 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  28.92 
 
 		 159 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>