10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1866 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1866  conserved hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1695  Snf7  71.16 
 
 
221 aa  339  2e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1430  conserved hypothetical protein  68.97 
 
 
223 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2179  hypothetical protein  66.5 
 
 
211 aa  281  4.0000000000000003e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54958  hitchhiker  0.000254205 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0061  hypothetical protein  36.82 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0029  hypothetical protein  34.85 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0816  SNF7 protein  31.19 
 
 
216 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.283391 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1891  conserved hypothetical protein  35.76 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.522365  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1671  hypothetical protein  35.06 
 
 
270 aa  105  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000972701  normal  0.698741 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1090  hypothetical protein  19.79 
 
 
185 aa  42  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>