16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0045 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0045  Suppressor Mra1 family protein  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0747  ribosome biogenesis protein  57.89 
 
 		 209 aa  248  6e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0675798  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0820  ribosome biogenesis protein  40.87 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1590  ribosome biogenesis protein  40.3 
 
 		 221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2054  ribosome biogenesis protein  41.33 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.532085 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0557  ribosome biogenesis protein  38.77 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1803  ribosome biogenesis protein  39.91 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.022092  normal  0.296556 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1625  ribosome biogenesis protein  36.79 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0188  ribosome biogenesis protein  37.44 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0625  ribosome biogenesis protein  36 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0915  Suppressor Mra1 family protein  38.5 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13379  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02759  RNA processing protein Emg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06010)  31.58 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.458215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55133  predicted protein  30.32 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0189665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39810  predicted protein  31.55 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.368845  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01990  nucleolar essential protein 1, putative  44.74 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11653  predicted protein  29.59 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>