More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2806 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
163 aa  338  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1851  GCN5-related N-acetyltransferase  67.28 
 
 
163 aa  233  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000258649  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0903  GCN5-related N-acetyltransferase  59.63 
 
 
173 aa  206  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2792  acetyltransferase  56.05 
 
 
178 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0881  GCN5-related N-acetyltransferase  56.52 
 
 
178 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3186  GCN5-related N-acetyltransferase  51.57 
 
 
170 aa  184  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.167561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  50.62 
 
 
163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155253  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2571  GCN5-related N-acetyltransferase  51.25 
 
 
163 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000321902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2687  GCN5-related N-acetyltransferase  50.62 
 
 
185 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000216102  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
163 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000218796  hitchhiker  0.000817429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1266  GCN5-related N-acetyltransferase  51.55 
 
 
165 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5404  GCN5-related N-acetyltransferase  49.07 
 
 
166 aa  173  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0298216  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4857  GCN5-related N-acetyltransferase  49.07 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  52.5 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0124  GCN5-related N-acetyltransferase  48.15 
 
 
166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3272  GCN5-related N-acetyltransferase  48.77 
 
 
194 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150015 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3814  putative acetyltransferase YhhY  47.2 
 
 
162 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  49.38 
 
 
172 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.847229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3916  putative acetyltransferase YhhY  47.2 
 
 
162 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.73756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5328  GCN5-related N-acetyltransferase  47.53 
 
 
166 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4739  GCN5-related N-acetyltransferase  47.53 
 
 
166 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613955  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3736  putative acetyltransferase YhhY  47.2 
 
 
162 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5533  GCN5-related N-acetyltransferase  47.53 
 
 
166 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3747  putative acetyltransferase YhhY  47.2 
 
 
162 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3086  GCN5-related N-acetyltransferase  48.47 
 
 
165 aa  168  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0846  putative acetyltransferase  49.38 
 
 
169 aa  168  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3857  putative acetyltransferase YhhY  46.58 
 
 
162 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  47.53 
 
 
162 aa  165  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.858173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03292  predicted acetyltransferase  45.34 
 
 
162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0151809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3884  putative acetyltransferase YhhY  45.34 
 
 
162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3920  putative acetyltransferase YhhY  45.34 
 
 
162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03245  hypothetical protein  45.34 
 
 
162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0209792  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3725  putative acetyltransferase YhhY  46.3 
 
 
162 aa  160  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4759  putative acetyltransferase YhhY  44.72 
 
 
162 aa  159  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.558368  normal  0.225822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4688  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 
169 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185448  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3640  putative acetyltransferase YhhY  45.34 
 
 
162 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0272  putative acetyltransferase YhhY  45.34 
 
 
162 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.417468  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  44.72 
 
 
162 aa  158  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2612  acetyltransferase, GNAT family  46.25 
 
 
167 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000687375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2506  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 
171 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611221  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
175 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.160145 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001236  histone acetyltransferase HPA2  43.48 
 
 
166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.993571  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05103  acetyltransferase  42.24 
 
 
166 aa  142  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2870  acetyltransferase  44.59 
 
 
160 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2839  GCN5-related N-acetyltransferase  43.4 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0772074  normal  0.0165254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  42.77 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46440  putative acetyltransferase  41.77 
 
 
177 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000264759  hitchhiker  0.000775438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4021  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
166 aa  124  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193056  normal  0.623875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4008  acetyltransferase  40.51 
 
 
177 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 
181 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74926  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0879  GCN5-related N-acetyltransferase  37.89 
 
 
161 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1180  acetyltransferase (GNAT) family protein  39.38 
 
 
168 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2295  GCN5-related N-acetyltransferase  41.72 
 
 
175 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.4166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3765  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2621  GCN5-related N-acetyltransferase  41.72 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0308502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4060  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3125  acetyltransferase  39.63 
 
 
191 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3240  acetyltransferase  39.63 
 
 
191 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2063  acetyltransferase  39.63 
 
 
191 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475157  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2357  acetyltransferase  39.63 
 
 
191 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1456  acetyltransferase  39.63 
 
 
191 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1372  acetyltransferase  39.63 
 
 
191 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.519651  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1092  acetyltransferase  39.63 
 
 
191 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4402  GCN5-related N-acetyltransferase  39.75 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2212  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
165 aa  111  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0659  GCN5-related N-acetyltransferase  35.98 
 
 
172 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2987  ribosomal-protein- alanine GNAT family acetyltransferase  34.59 
 
 
193 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 
182 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508439  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2986  GNAT family acetyltransferase  33.95 
 
 
182 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0811  acetyltransferase  32.72 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000146816  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1454  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
193 aa  97.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2447  acetyltransferase  35.4 
 
 
170 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000832578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2168  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.02 
 
 
170 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2953  acetyltransferase, GNAT family  36.65 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.323576  hitchhiker  0.000000100965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2378  acetyltransferase, GNAT family  36.02 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2181  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.4 
 
 
170 aa  95.5  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000136101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2430  acetyltransferase, GNAT family  35.4 
 
 
170 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.32582 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2511  acetyltransferase, GNAT family  35.4 
 
 
170 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.037927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2248  acetyltransferase  34.78 
 
 
170 aa  94.4  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000532423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2412  acetyltransferase  34.78 
 
 
170 aa  94.4  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2225  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00859735  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2338  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
177 aa  73.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174627  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0798  acetyltransferase  31.47 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.126985  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0377  acetyltransferase  35.25 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.709528  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0342  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2667  GCN5-related N-acetyltransferase  34.4 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.065079  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  33.07 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0341  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  30.77 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1316  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
175 aa  67.4  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3260  acetyltransferase  39.08 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3126  acetyltransferase  33.71 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.47822  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0680  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2064  acetyltransferase  33.71 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0695  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.107584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1457  acetyltransferase  33.71 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1093  acetyltransferase  33.71 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1373  acetyltransferase  33.71 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.831181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>