66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1221 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1221  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  216  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000118291  normal  0.537275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3366  hypothetical protein  77.78 
 
 		 108 aa  169  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1183  hypothetical protein  77.14 
 
 		 108 aa  167  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000366643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1253  hypothetical protein  77.14 
 
 		 108 aa  167  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000738025  normal  0.482824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1182  hypothetical protein  77.14 
 
 		 108 aa  167  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3194  hypothetical protein  78.5 
 
 		 108 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102444  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3037  hypothetical protein  78.5 
 
 		 108 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00372208  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3051  hypothetical protein  78.5 
 
 		 108 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000531694  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1327  hypothetical protein  78.5 
 
 		 108 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00305536  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2698  hypothetical protein  78.5 
 
 		 108 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2696  hypothetical protein  73.33 
 
 		 108 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.386923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1321  hypothetical protein  83.02 
 
 		 107 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.225531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1125  hypothetical protein  81.31 
 
 		 107 aa  160  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00669811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1110  hypothetical protein  75.53 
 
 		 108 aa  154  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000173237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2488  hypothetical protein  72.04 
 
 		 108 aa  147  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.516782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2871  hypothetical protein  73.12 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0736  protein of unknown function DUF469  55.77 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02752  hypothetical protein  55.77 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0018513  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3120  hypothetical protein  55.77 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3304  hypothetical protein  55.77 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3392  hypothetical protein  55.77 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0755  hypothetical protein  55.77 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3102  hypothetical protein  55.77 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02789  hypothetical protein  55.77 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00171034  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4263  hypothetical protein  54.81 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.479777 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3282  hypothetical protein  53.85 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0610455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3364  hypothetical protein  55.66 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574157 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3451  hypothetical protein  52.88 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.503448 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3272  hypothetical protein  52.88 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3348  hypothetical protein  52.88 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3356  hypothetical protein  52.88 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.511055 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0884  hypothetical protein  53.85 
 
 		 114 aa  120  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0821  hypothetical protein  53.85 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0822  hypothetical protein  53.85 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.296025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0148  hypothetical protein  53.85 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0328045  hitchhiker  0.00000055934 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3204  hypothetical protein  49.04 
 
 		 114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0652722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4041  hypothetical protein  52.88 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0415023 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3405  hypothetical protein  51.92 
 
 		 114 aa  116  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00230899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3024  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.628409  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4147  hypothetical protein  43.81 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1661  hypothetical protein  43.69 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000330236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2112  hypothetical protein  42.2 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0216997  normal  0.224455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2315  hypothetical protein  42.2 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1791  hypothetical protein  43.12 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1618  hypothetical protein  41.28 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1799  protein of unknown function DUF469  41.51 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2000  hypothetical protein  41.51 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.267293  normal  0.17767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2099  hypothetical protein  40.37 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543724  normal  0.0806455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3640  hypothetical protein  40.37 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0961434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1611  hypothetical protein  40.37 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0388695  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3007  hypothetical protein  38.53 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000697819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24700  hypothetical protein  40.37 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2092  hypothetical protein  40.37 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3653  hypothetical protein  37.84 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0789  hypothetical protein  40.95 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1954  hypothetical protein  35.85 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0686  hypothetical protein  34.26 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3336  hypothetical protein  34.26 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1301  hypothetical protein  32.41 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0976  hypothetical protein  31.73 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2340  hypothetical protein  29.81 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2219  hypothetical protein  30.1 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5643  hypothetical protein  27.88 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1690  hypothetical protein  27.88 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2325  hypothetical protein  27.88 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227991  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2302  hypothetical protein  27.88 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>