17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3838 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3838  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4272  hypothetical protein  76.67 
 
 
180 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4411  hypothetical protein  76.67 
 
 
180 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1892  hypothetical protein  62.01 
 
 
179 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3458  hypothetical protein  62.01 
 
 
179 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3419  hypothetical protein  60.66 
 
 
178 aa  189  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.735509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4017  hypothetical protein  57.54 
 
 
175 aa  187  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0146  hypothetical protein  32.16 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2554  hypothetical protein  32.16 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2282  hypothetical protein  31.1 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445017  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0961  hypothetical protein  30.17 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0196  hypothetical protein  46.97 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4197  hypothetical protein  28.57 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0079  hypothetical protein  31.43 
 
 
146 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3860  hypothetical protein  30 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.577525  normal  0.0161383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3892  hypothetical protein  23.84 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4177  hypothetical protein  28.16 
 
 
182 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>