17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1892 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1892  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  360  6e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3458  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  360  6e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4272  hypothetical protein  62.78 
 
 
180 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4411  hypothetical protein  62.78 
 
 
180 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3838  hypothetical protein  62.01 
 
 
179 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4017  hypothetical protein  60.34 
 
 
175 aa  201  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3419  hypothetical protein  60.56 
 
 
178 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.735509  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2282  hypothetical protein  29.75 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445017  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0961  hypothetical protein  32.02 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2554  hypothetical protein  31.64 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0146  hypothetical protein  31.64 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0196  hypothetical protein  30.51 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4197  hypothetical protein  34.46 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3860  hypothetical protein  33.52 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.577525  normal  0.0161383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0079  hypothetical protein  26.62 
 
 
146 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4177  hypothetical protein  27.11 
 
 
182 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3892  hypothetical protein  24.71 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>