20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3623 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3623  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  283  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3243  hypothetical protein  63.21 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984975  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6938  hypothetical protein  55.91 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2873  hypothetical protein  40.98 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1174  hypothetical protein  37.61 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0980  hypothetical protein  34.65 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00330636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0008  monoheme cytochrome c, putative  36.73 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0008  monoheme cytochrome c, putative  36.73 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0716  monoheme cytochrome c, putative  33.61 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0008  monoheme cytochrome c, putative  35.71 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000351615 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0004  hypothetical protein  40.91 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408251  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0030  hypothetical protein  39.77 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.593403  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0008  hypothetical protein  38.64 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2982  hypothetical protein  35.94 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3395  cytochrome c oxidoreductase subunit B  28.57 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354922  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0917  hypothetical protein  37.5 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606921  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4082  hypothetical protein  35.71 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3097  cytochrome c-552 like protein  33.9 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0948  hypothetical protein  28.79 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.356447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2837  hypothetical protein  29.23 
 
 		 218 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>