45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1516 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1516  ferric iron reductase  100 
 
 
345 aa  714    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00751668  normal  0.821381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1450  ferric iron reductase  90.15 
 
 
345 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.756518  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1506  ferric iron reductase  81.9 
 
 
344 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3034  ferric iron reductase protein, putative  53.85 
 
 
361 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1652  ferric iron reductase  40.38 
 
 
377 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000058047  hitchhiker  0.0000000000759871 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2415  ferric iron reductase  40.28 
 
 
374 aa  235  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2734  ferric iron reductase  40.79 
 
 
378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000124929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2813  ferric iron reductase  39.44 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00899637  normal  0.638181 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2712  ferric iron reductase  41.1 
 
 
378 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.810996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0527  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  29.48 
 
 
262 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  hitchhiker  0.00618312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4909  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  34.98 
 
 
262 aa  119  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000454777  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3630  ferric iron reductase  31.06 
 
 
262 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0343034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04210  hypothetical protein  31.06 
 
 
262 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3688  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  34.98 
 
 
262 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.141102  hitchhiker  0.000160651 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04244  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  31.06 
 
 
262 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0540348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5880  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  35.15 
 
 
262 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.061734  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4961  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  34.31 
 
 
262 aa  116  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4913  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  34.48 
 
 
262 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000171734  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4600  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  33.99 
 
 
262 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000151516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4958  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  27.34 
 
 
262 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.659446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4906  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  26.97 
 
 
262 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4964  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  27.34 
 
 
262 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0710242  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4871  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  28.68 
 
 
262 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00987545  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4803  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  26.97 
 
 
262 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal  0.863777 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3191  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  31.37 
 
 
259 aa  102  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182603  hitchhiker  0.00976656 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2449  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  31.37 
 
 
259 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.994573  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2548  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  31.37 
 
 
259 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3257  ferric iron reductase  25.9 
 
 
252 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2635  ferric iron reductase  23.9 
 
 
254 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4068  putative iron reductase  34.45 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42261  normal  0.237664 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4136  ferric iron reductase  27.09 
 
 
251 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2861  ferric iron reductase  24.89 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0523234 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4042  ferric iron reductase  26.19 
 
 
264 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0522  putative iron reductase  33.05 
 
 
272 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1555  ferric iron reductase  25.59 
 
 
266 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494875  normal  0.652655 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1612  ferric iron reductase  26.42 
 
 
266 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113316  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4783  ferric iron reductase  26.57 
 
 
267 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200161  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1601  ferric iron reductase  24.53 
 
 
266 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210983 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1637  ferric iron reductase  26.42 
 
 
266 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.081443  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1157  ferric iron reductase  26.42 
 
 
266 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270901  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5734  iron reductase  27.78 
 
 
261 aa  50.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1534  ferric iron reductase  25.6 
 
 
266 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.75472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3714  ferric iron reductase  24.5 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.73851  normal  0.0269433 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2422  ferric iron reductase protein FhuF  28.39 
 
 
264 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.122755  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1674  ferric iron reductase protein FhuF  28.04 
 
 
248 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>