267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0970 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  100 
 
 
106 aa  219  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  97.17 
 
 
106 aa  213  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  95.28 
 
 
106 aa  210  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  92.78 
 
 
97 aa  191  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  84.91 
 
 
106 aa  187  3e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  84.91 
 
 
106 aa  187  3e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  83.96 
 
 
106 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0936  BolA family protein  83.02 
 
 
106 aa  181  4e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.526813  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0920  BolA family protein  82.47 
 
 
97 aa  168  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  70.41 
 
 
99 aa  144  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  66.33 
 
 
99 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  70.97 
 
 
99 aa  137  4e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  61.22 
 
 
99 aa  137  5e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  61.22 
 
 
99 aa  133  7e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  61.22 
 
 
99 aa  129  2e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  58.59 
 
 
104 aa  124  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  58.59 
 
 
104 aa  121  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  56.12 
 
 
99 aa  120  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  53 
 
 
104 aa  120  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  53.06 
 
 
106 aa  116  1e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  53.06 
 
 
106 aa  116  1e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.09706e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  53.06 
 
 
106 aa  116  1e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.83213e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  54.55 
 
 
106 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  57.14 
 
 
103 aa  110  7e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  53.12 
 
 
104 aa  110  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  54.08 
 
 
106 aa  109  1e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  51.02 
 
 
104 aa  108  2e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.77187e-06  hitchhiker  2.75713e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  53.12 
 
 
104 aa  107  4e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  53.06 
 
 
105 aa  107  8e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  50 
 
 
102 aa  107  8e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  50 
 
 
104 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  50 
 
 
105 aa  103  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.55602e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  50 
 
 
105 aa  103  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  50 
 
 
105 aa  103  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.63176e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  50 
 
 
105 aa  103  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.54579e-07  hitchhiker  7.47363e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  50 
 
 
105 aa  103  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.13477e-08  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.4736e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  50 
 
 
105 aa  103  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.66564e-08  normal  0.439753 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  50 
 
 
105 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  3.27919e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  50 
 
 
104 aa  103  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.07281e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  52.04 
 
 
103 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14849  predicted protein  56.31 
 
 
127 aa  102  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  48.48 
 
 
104 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  47.96 
 
 
105 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  47.96 
 
 
105 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.29176e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  47.96 
 
 
105 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  47.96 
 
 
105 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  9.73663e-05  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  47.96 
 
 
105 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  47.96 
 
 
105 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  3.05516e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  47.96 
 
 
127 aa  96.7  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1880  hypothetical protein  47.37 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  44.9 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  47.47 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  41.41 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1891  hypothetical protein  45.16 
 
 
105 aa  87.8  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2224  BolA family protein  41.84 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  45.92 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  45.92 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  45.92 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  44.9 
 
 
98 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0031  BolA family protein  46.43 
 
 
102 aa  76.6  1e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  43.88 
 
 
99 aa  75.1  3e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  46.67 
 
 
98 aa  73.9  6e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  43.02 
 
 
97 aa  73.6  8e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  46.15 
 
 
101 aa  73.6  8e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  43.53 
 
 
95 aa  73.6  1e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  41.57 
 
 
98 aa  73.2  1e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  44.19 
 
 
102 aa  71.2  4e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  40.82 
 
 
97 aa  71.2  5e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  44.19 
 
 
89 aa  70.9  6e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  48.19 
 
 
89 aa  70.9  6e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  41.86 
 
 
101 aa  70.9  6e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  43.82 
 
 
92 aa  70.5  8e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  40.23 
 
 
91 aa  70.1  1e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  45.45 
 
 
90 aa  70.1  1e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  35.71 
 
 
101 aa  68.9  2e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  43.18 
 
 
94 aa  69.3  2e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  42.22 
 
 
98 aa  69.3  2e-11  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  43.96 
 
 
101 aa  68.9  2e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  48.1 
 
 
89 aa  68.2  4e-11  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  43.37 
 
 
93 aa  67.8  5e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  42.05 
 
 
92 aa  67.4  7e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  39.77 
 
 
119 aa  66.2  1e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  39.77 
 
 
92 aa  65.5  2e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  37 
 
 
114 aa  65.5  2e-10  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  37 
 
 
114 aa  65.9  2e-10  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  43.21 
 
 
93 aa  65.5  2e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  37.78 
 
 
104 aa  65.1  3e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  43.9 
 
 
91 aa  65.1  3e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  36.56 
 
 
104 aa  65.1  3e-10  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  41.57 
 
 
108 aa  64.7  4e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3067  transcriptional regulator BolA  40 
 
 
100 aa  64.3  6e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02420  conserved hypothetical protein  40.62 
 
 
161 aa  63.9  8e-10  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39406  predicted protein  36.36 
 
 
109 aa  63.5  9e-10  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  36.26 
 
 
104 aa  63.5  9e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  40.86 
 
 
101 aa  62.4  2e-09  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  38.1 
 
 
96 aa  61.6  3e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  34.78 
 
 
98 aa  61.6  3e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  39.02 
 
 
105 aa  60.1  9e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.082138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>