245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2602 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2602  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
461 aa  938  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.25 
 
 
462 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.35 
 
 
460 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.97 
 
 
451 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
453 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.75 
 
 
451 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0775  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
451 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344543  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
453 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6179  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.04 
 
 
458 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0625  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
453 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.43 
 
 
452 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5927  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.35 
 
 
459 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1215  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 
451 aa  373  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
453 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.17 
 
 
457 aa  362  7e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.275384  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2760  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.85 
 
 
449 aa  361  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1780  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.35 
 
 
441 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1985  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.62 
 
 
447 aa  360  4e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000236264  hitchhiker  0.00837081 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0122  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 
465 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
460 aa  349  5e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  47.74 
 
 
451 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0320218  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10583  nicotinate phosphoribosyltransferase  47.23 
 
 
463 aa  343  3e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.127794  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2646  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.8 
 
 
450 aa  341  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159209  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.77 
 
 
445 aa  340  3e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  41.23 
 
 
446 aa  337  2e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.64 
 
 
476 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112042  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2289  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.96 
 
 
481 aa  319  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1758  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.05 
 
 
475 aa  319  8e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1071  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.64 
 
 
483 aa  318  9e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.07171e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0113  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 
476 aa  315  1e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.22 
 
 
485 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1046  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.3 
 
 
489 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  39.95 
 
 
458 aa  308  2e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0996  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.73 
 
 
501 aa  305  2e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0354541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2253  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 
484 aa  303  3e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4911  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.63 
 
 
489 aa  303  6e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489735  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1964  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.07 
 
 
484 aa  302  7e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0253491  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.12 
 
 
488 aa  301  1e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
477 aa  299  7e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.39 
 
 
468 aa  299  8e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0174  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 
478 aa  298  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1011  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.17 
 
 
468 aa  297  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3836  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
485 aa  297  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0322574  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.78 
 
 
486 aa  295  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.914728  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3666  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
495 aa  294  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335827  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0528  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.2 
 
 
498 aa  294  3e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.633345  unclonable  4.75164e-08 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 
486 aa  292  8e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0322  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.78 
 
 
467 aa  290  5e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0344  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.69 
 
 
467 aa  289  9e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2627  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.74 
 
 
489 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 
490 aa  285  1e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.56 
 
 
491 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1417  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 
490 aa  282  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414202  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 
489 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 
489 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1227  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.88 
 
 
490 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.507813  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0890  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 
475 aa  281  2e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
480 aa  280  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2236  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 
465 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.605686 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3664  nicotinate phosphoribosyltransferase related  40.05 
 
 
491 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.211664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
487 aa  276  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3220  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.91 
 
 
458 aa  276  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3722  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.3 
 
 
491 aa  277  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.46 
 
 
487 aa  276  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
487 aa  276  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.46 
 
 
487 aa  276  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
487 aa  276  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
487 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3805  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.3 
 
 
491 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
487 aa  275  1e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1540  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.14 
 
 
480 aa  275  1e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.85 
 
 
487 aa  274  2e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 
487 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7551e-11 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 
487 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 
487 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0632  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 
505 aa  273  4e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.037982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0293  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.62 
 
 
458 aa  273  4e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1148  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.55 
 
 
486 aa  273  6e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.24916  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0271  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.17 
 
 
451 aa  269  6e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1180  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.44 
 
 
458 aa  269  7e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.690233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2987  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 
479 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0271  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 
451 aa  267  3e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3792  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  42.73 
 
 
491 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.94991 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09180  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  41.01 
 
 
489 aa  265  1e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.346116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5746  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.01 
 
 
523 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16160  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  39.69 
 
 
486 aa  263  5e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.62808e-07 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0414  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.29 
 
 
459 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.96 
 
 
489 aa  262  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.532365  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0227  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 
456 aa  257  4e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0281  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 
456 aa  255  1e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.168647  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0255  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
456 aa  254  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0318  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.91 
 
 
459 aa  252  8e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1202  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.59 
 
 
490 aa  252  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0273  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 
484 aa  249  8e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0655  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 
481 aa  244  2e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0295  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.81 
 
 
486 aa  243  5e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1004  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.32 
 
 
437 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704184  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 
438 aa  230  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1946  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 
516 aa  230  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0457776  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2586  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  36.93 
 
 
442 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>