23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0012 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0012    100 
 
 		 2436 bp  4829    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0324  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  81.76 
 
 		 1959 bp  79.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.574765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3583  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  81.56 
 
 		 1998 bp  73.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0149  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  81.56 
 
 		 1998 bp  73.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0811  heterodisulfide reductase subunit  92.31 
 
 		 1983 bp  71.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746765 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3526  heterodisulfide reductase, A subunit  86.08 
 
 		 1959 bp  69.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  91.84 
 
 		 1962 bp  65.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3426  heterodisulfide reductase subunit  91.3 
 
 		 1998 bp  60  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0090  heterodisulfide reductase subunit  91.3 
 
 		 1998 bp  60  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.078699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1976  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  81.9 
 
 		 204 bp  58  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  91.11 
 
 		 3042 bp  58  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1209  heterodisulfide reductase, A subunit  91.11 
 
 		 1983 bp  58  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0421  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  94.59 
 
 		 2025 bp  58  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.46069 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0030  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  92.5 
 
 		 1998 bp  56  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  94.29 
 
 		 2376 bp  54  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0029  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  94.29 
 
 		 1998 bp  54  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0850  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  87.27 
 
 		 1983 bp  54  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1177  heterodisulfide reductase, subunit A, polyferredoxin  87.04 
 
 		 168 bp  52  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0565  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  94.12 
 
 		 1986 bp  52  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17770  polyferredoxin, heterodixulfide reductase subunit A  88 
 
 		 1983 bp  52  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1977  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  96.55 
 
 		 3066 bp  50.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0397  heterodisulfide reductase, subunit A, selenocysteine-containing  96.55 
 
 		 1386 bp  50.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  96.55 
 
 		 1959 bp  50.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>