18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3419 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3419  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  360  5.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.735509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4017  hypothetical protein  67.42 
 
 		 175 aa  233  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3458  hypothetical protein  60.89 
 
 		 179 aa  214  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1892  hypothetical protein  60.89 
 
 		 179 aa  214  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4272  hypothetical protein  60 
 
 		 180 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4411  hypothetical protein  60 
 
 		 180 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3838  hypothetical protein  60.66 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0961  hypothetical protein  35.75 
 
 		 178 aa  92  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2554  hypothetical protein  34.43 
 
 		 189 aa  90.9  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0146  hypothetical protein  34.43 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2282  hypothetical protein  34.84 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0196  hypothetical protein  29.94 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4197  hypothetical protein  30.25 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4177  hypothetical protein  32.34 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3860  hypothetical protein  28.9 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.577525  normal  0.0161383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0079  hypothetical protein  45.16 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3892  hypothetical protein  27.06 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06216  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  48.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>