12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0088 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004632  PSPTO_B0066  traU protein  49.36 
 
 		 1018 aa  1043    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.865  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0060  traU protein  49.46 
 
 		 1015 aa  1042    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0088  TraU  100 
 
 		 1014 aa  2102    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.83032 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0498  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1009 aa  347  6e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0522  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1009 aa  347  8e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0376  IcmB  27.17 
 
 		 1003 aa  333  1e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1806  IcmB protein  27.17 
 
 		 1003 aa  333  1e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3870  DotO  25.32 
 
 		 1018 aa  283  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.103513  normal  0.825966 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0121  putative type IV secretion system protein IcmB/DotO  24.77 
 
 		 1031 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4253  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1019 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5592  hypothetical protein  24.53 
 
 		 995 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0517129  normal  0.0408672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1791  type II and III secretion system protein  34.04 
 
 		 524 aa  47  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.561359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>