251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1325 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  100 
 
 
348 aa  694    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  89.68 
 
 
348 aa  607  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  89.68 
 
 
348 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  90.09 
 
 
350 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  89.61 
 
 
349 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  89.38 
 
 
348 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  89.38 
 
 
348 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  93.81 
 
 
351 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  90.09 
 
 
350 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  90.09 
 
 
350 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  90.09 
 
 
350 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  88.79 
 
 
348 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  92.21 
 
 
345 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  86.49 
 
 
347 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1619  flagellar motor switch protein G  88.76 
 
 
349 aa  598  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1362  flagellar motor switch protein G  89.7 
 
 
349 aa  595  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  75.94 
 
 
346 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  77.58 
 
 
351 aa  501  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  73.64 
 
 
351 aa  498  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2307  flagellar motor switch protein G  70.39 
 
 
350 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03161  flagellar motor switch protein G  68.39 
 
 
351 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  68.1 
 
 
351 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1716  flagellar motor switch protein G  71.52 
 
 
338 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  58.46 
 
 
338 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  59.08 
 
 
338 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  57.85 
 
 
338 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  57.14 
 
 
339 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  56.92 
 
 
333 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  55.08 
 
 
339 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  55.25 
 
 
337 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  55.69 
 
 
339 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  56.62 
 
 
338 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  54.31 
 
 
346 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  54.85 
 
 
338 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  55.08 
 
 
339 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  54.77 
 
 
339 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  54.46 
 
 
347 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  50.62 
 
 
334 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  51.36 
 
 
334 aa  348  9e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  50.9 
 
 
336 aa  347  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  50.9 
 
 
336 aa  347  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  48.93 
 
 
337 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  49.4 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  49.23 
 
 
334 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  51.21 
 
 
346 aa  325  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  47.83 
 
 
329 aa  324  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  49.85 
 
 
333 aa  320  3e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  46.13 
 
 
329 aa  318  6e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  46.13 
 
 
329 aa  318  9e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  49.09 
 
 
331 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2976  flagellar motor switch protein G  47.34 
 
 
331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3110  flagellar motor switch protein G  47.34 
 
 
331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3062  flagellar motor switch protein G  46.34 
 
 
331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  46.65 
 
 
333 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0199  flagellar motor switch protein G  46.34 
 
 
331 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2451  flagellar motor switch protein G  46.65 
 
 
331 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00544517  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3065  flagellar motor switch protein G  46.65 
 
 
331 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00336873  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3084  flagellar motor switch protein G  46.65 
 
 
331 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2900  flagellar motor switch protein FliG  49.39 
 
 
333 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3280  flagellar motor switch protein G  46.34 
 
 
331 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0416  flagellar motor switch protein G  46.34 
 
 
331 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2945  flagellar motor switch protein G  46.34 
 
 
331 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0221  flagellar motor switch protein G  46.34 
 
 
331 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0619042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0233  flagellar motor switch protein G  46.34 
 
 
331 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631477  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1879  flagellar motor switch protein FliG  48.91 
 
 
333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246079  normal  0.586274 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4730  flagellar motor switch protein G  46.44 
 
 
330 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.231859  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2143  flagellar motor switch protein G  46.04 
 
 
331 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3401  flagellar motor switch protein G  46.04 
 
 
331 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3653  flagellar motor switch protein G  46.44 
 
 
330 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.552774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6414  flagellar motor switch protein G  47.02 
 
 
331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3771  flagellar motor switch protein G  46.13 
 
 
331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0165  flagellar motor switch protein G  46.13 
 
 
331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0391  flagellar motor switch protein G  45.51 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977742  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  47.83 
 
 
331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2932  flagellar motor switch protein G  44.89 
 
 
331 aa  305  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  46.89 
 
 
331 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1114  flagellar motor switch protein FliG  47.26 
 
 
331 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  46.63 
 
 
331 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0551  flagellar motor switch protein FliG  46.04 
 
 
332 aa  299  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1346  flagellar motor switch protein FliG  46.73 
 
 
332 aa  298  7e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1541  flagellar motor switch protein G  46.53 
 
 
330 aa  292  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  46.27 
 
 
331 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2013  flagellar motor switch protein G  45.18 
 
 
330 aa  288  9e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2291  flagellar motor switch protein G  45.18 
 
 
330 aa  288  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.60642  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2392  flagellar motor switch protein G  45.18 
 
 
330 aa  288  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178254  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1575  flagellar motor switch protein G  45.32 
 
 
330 aa  288  9e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2576  flagellar motor switch protein G  45.05 
 
 
330 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0189022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1890  flagellar motor switch protein G  44.74 
 
 
330 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2948  flagellar motor switch protein G  44.44 
 
 
330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0054  flagellar motor switch protein FliG  43.25 
 
 
340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1956  flagellar motor switch protein FliG  44.07 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1689  flagellar motor switch protein FliG  43.25 
 
 
340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00159309  hitchhiker  0.00060474 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5262  flagellar motor switch protein G  42.41 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0777701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5098  flagellar motor switch protein G  42.64 
 
 
337 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1709  flagellar motor switch protein FliG  44.31 
 
 
331 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.311791  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2039  flagellar motor switch protein G  44.31 
 
 
331 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1703  flagellar motor switch protein G  44.31 
 
 
331 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0342564 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2172  flagellar motor switch protein G  44.31 
 
 
331 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.450504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2715  flagellar motor switch protein G  44.31 
 
 
331 aa  277  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1245  flagellar motor switch protein G  44.31 
 
 
331 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>