51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0051 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0051  hypothetical protein  100 
 
 
54 aa  112  2e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0023  hypothetical protein  69.81 
 
 
53 aa  85.1  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0019  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  66 
 
 
50 aa  77.4  6e-14  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00405758  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0861  hypothetical protein  60.71 
 
 
64 aa  73.6  1e-12  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4059  hypothetical protein  68.89 
 
 
54 aa  71.6  4e-12  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0426  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  65 
 
 
893 aa  64.7  4e-10  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2768  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  67.5 
 
 
608 aa  64.3  5e-10  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.722905  hitchhiker  1.87982e-05 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0455  hypothetical protein  61.7 
 
 
61 aa  63.9  8e-10  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0030661  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0305  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  58.14 
 
 
629 aa  60.8  6e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113243 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2207  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  60.47 
 
 
636 aa  60.1  9e-09  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2107  hypothetical protein  68.42 
 
 
58 aa  60.1  1e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45526  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1783  hypothetical protein  68.42 
 
 
58 aa  60.1  1e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0846066  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_003296  RS02295  hypothetical protein  68.42 
 
 
58 aa  59.3  2e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4658  hypothetical protein  65.79 
 
 
58 aa  58.2  4e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3581  hypothetical protein  65.79 
 
 
58 aa  58.2  4e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972578  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0369  hypothetical protein  55.1 
 
 
67 aa  58.2  4e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0086  hypothetical protein  55.32 
 
 
63 aa  57.8  6e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0105  hypothetical protein  55.32 
 
 
63 aa  57.8  6e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5138  hypothetical protein  64.1 
 
 
63 aa  57.4  6e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.26264 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1693  hypothetical protein  55.1 
 
 
63 aa  57.4  7e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0301562  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2719  hypothetical protein  58.14 
 
 
68 aa  57  9e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2341  hypothetical protein  58.14 
 
 
68 aa  57  9e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0134441 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2903  hypothetical protein  57.14 
 
 
70 aa  56.6  1e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.314108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2743  hypothetical protein  57.14 
 
 
70 aa  56.2  1e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1699  hypothetical protein  57.14 
 
 
70 aa  56.6  1e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2686  hypothetical protein  57.14 
 
 
70 aa  56.6  1e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0628  hypothetical protein  57.14 
 
 
70 aa  56.6  1e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497536  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2384  hypothetical protein  57.14 
 
 
70 aa  56.6  1e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2988  hypothetical protein  61.54 
 
 
60 aa  56.2  1e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397696  normal  0.373274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39700  hypothetical protein  61.9 
 
 
48 aa  55.5  2e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1780  hypothetical protein  55.81 
 
 
58 aa  55.5  2e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.219233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3366  hypothetical protein  59.09 
 
 
48 aa  56.2  2e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.278826  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1275  hypothetical protein  55.81 
 
 
58 aa  55.8  2e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3516  hypothetical protein  51.02 
 
 
61 aa  54.3  5e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.196587 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2808  hypothetical protein  58.54 
 
 
899 aa  54.7  5e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3480  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  69.7 
 
 
627 aa  52.8  2e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.308899  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2641  hypothetical protein  48.89 
 
 
63 aa  51.6  4e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1473  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  62.07 
 
 
704 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3397  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.29 
 
 
686 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1144  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.55 
 
 
692 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0333221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0421  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.43 
 
 
689 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3016  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.52 
 
 
685 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0978  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  58.62 
 
 
630 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2273  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.57 
 
 
718 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.414975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0535  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.88 
 
 
800 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  2.1031e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1401  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50 
 
 
710 aa  41.6  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00712493  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1191  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.12 
 
 
730 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112053 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1057  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.57 
 
 
721 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0513  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  56.25 
 
 
623 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0068  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.17 
 
 
697 aa  40.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1601  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.84 
 
 
706 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>