15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3572 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3572  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  803    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3777  hypothetical protein  31.53 
 
 		 420 aa  149  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4861  hypothetical protein  30.6 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0079  hypothetical protein  30.08 
 
 		 436 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0076  hypothetical protein  31 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4275  hypothetical protein  31.52 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0074  hypothetical protein  31.52 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3974  hypothetical protein  29.9 
 
 		 430 aa  136  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0071  hypothetical protein  28.61 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0074  hypothetical protein  31.66 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4187  hypothetical protein  29.98 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0060  hypothetical protein  31.78 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0077  hypothetical protein  30.94 
 
 		 436 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0079  hypothetical protein  30.94 
 
 		 436 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0075  hypothetical protein  30.94 
 
 		 436 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>