88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sa5SF on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG_r03  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  232  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG_r02  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  232  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0289952  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG_r01  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  232  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.873865  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa5SF  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  232  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa5SD  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  232  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG_r05  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  232  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG_r04  5S ribosomal RNA  100 
 
 
117 bp  232  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.866925  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0184  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
127 bp  161  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00848557  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0171  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
124 bp  161  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.114955  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0082  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
124 bp  161  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0022  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
124 bp  161  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0311578  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0412  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
124 bp  161  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0961397  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1781  5S ribosomal RNA  92.31 
 
 
127 bp  161  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.386687  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0555  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 
116 bp  85.7  2e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2448  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 
116 bp  85.7  2e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2176  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 
116 bp  85.7  2e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2569  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 
116 bp  85.7  2e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2606  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 
116 bp  85.7  2e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2491  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 
116 bp  85.7  2e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0025  5S ribosomal RNA  86.75 
 
 
83 bp  77.8  6e-13  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000694751  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0062  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 
121 bp  69.9  1e-10  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.6841e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0011  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 
120 bp  69.9  1e-10  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0005  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 
119 bp  69.9  1e-10  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.85376e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0077  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 
121 bp  69.9  1e-10  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1797  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 
119 bp  65.9  2e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  7.20962e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1803  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 
119 bp  65.9  2e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.67597e-15 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0022  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 
89 bp  65.9  2e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0166  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 
89 bp  65.9  2e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1705  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 
89 bp  65.9  2e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1832  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 
89 bp  65.9  2e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.172239  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1618  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 
119 bp  65.9  2e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.636533 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1583  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 
119 bp  65.9  2e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1564  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 
119 bp  65.9  2e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0451  5S ribosomal RNA  97.3 
 
 
119 bp  65.9  2e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.135782 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0050  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 
120 bp  61.9  3e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0026  5S ribosomal RNA  87.3 
 
 
120 bp  61.9  3e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SD  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
115 bp  60  1e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SE  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
115 bp  60  1e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0079  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
119 bp  60  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0068  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
114 bp  60  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0063  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
114 bp  60  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0022  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
114 bp  60  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0019  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
119 bp  60  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.296052  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SB  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
115 bp  60  1e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0481886  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0007  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
114 bp  60  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0528996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0008  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
114 bp  60  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  5.37705e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0009  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 
116 bp  60  1e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0008  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 
116 bp  60  1e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0003  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 
116 bp  60  1e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000187832  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0057  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 
116 bp  60  1e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0079  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
114 bp  60  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0068  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
114 bp  60  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0063  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
114 bp  60  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0023  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
114 bp  60  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0020  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
114 bp  60  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0008  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
119 bp  60  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  8.08782e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0007  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
119 bp  60  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SG  1 ribosomal RNA  97.06 
 
 
115 bp  60  1e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  3.0846e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SF  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
115 bp  60  1e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0380  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
109 bp  60  1e-07  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0833  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
109 bp  60  1e-07  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SA  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
115 bp  60  1e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SC  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
115 bp  60  1e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0053  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 
111 bp  58  5e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0282002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0048  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 
111 bp  58  5e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0423  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
111 bp  52  3e-05  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r0656  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
36 bp  52  3e-05  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.757563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0092  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
117 bp  52  3e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.214269  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr06  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
76 bp  52  3e-05  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r1370  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
36 bp  52  3e-05  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr03  5S ribosomal RNA  94.12 
 
 
103 bp  52  3e-05  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0033  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
117 bp  52  3e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0049  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
117 bp  52  3e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0052  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
117 bp  52  3e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0076  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
117 bp  52  3e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0020  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
117 bp  52  3e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0018  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
117 bp  52  3e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0005  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 
117 bp  52  3e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0068  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
116 bp  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0042  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
116 bp  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.488998  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0005  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
117 bp  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0003  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
116 bp  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.73811e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0054  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
117 bp  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.57756e-05  decreased coverage  0.000469584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0028  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
117 bp  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0420198  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0018  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 
117 bp  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0024  5S ribosomal RNA  89.74 
 
 
117 bp  46.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0027  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 
205 bp  44.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.866898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0059  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 
205 bp  44.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>