88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_r2176 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_r0555  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2176  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2448  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2491  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2606  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2569  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0025  5S ribosomal RNA  90.36 
 
 		 83 bp  101  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000694751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG_r02  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0289952  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG_r05  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG_r04  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.866925  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG_r03  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG_r01  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.873865  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa5SF  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa5SD  5S ribosomal RNA  87.95 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1781  5S ribosomal RNA  88.16 
 
 		 127 bp  79.8  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.386687  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0022  5S ribosomal RNA  88.16 
 
 		 124 bp  79.8  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0311578  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0082  5S ribosomal RNA  88.16 
 
 		 124 bp  79.8  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0171  5S ribosomal RNA  88.16 
 
 		 124 bp  79.8  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.114955  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0184  5S ribosomal RNA  88.16 
 
 		 127 bp  79.8  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00848557  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0412  5S ribosomal RNA  88.16 
 
 		 124 bp  79.8  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0961397  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0005  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185376  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1803  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167597 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1797  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.20962e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1618  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.636533 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1583  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1564  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0451  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 119 bp  63.9  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.135782 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0077  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 121 bp  63.9  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0062  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 121 bp  63.9  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000016841  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0011  5S ribosomal RNA  97.22 
 
 		 120 bp  63.9  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0019  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.296052  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SB  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0481886  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0079  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0068  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0063  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0023  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0020  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0007  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0008  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0068  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0022  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0079  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0007  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0528996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0008  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000537705  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0063  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SA  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SC  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SD  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SE  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SF  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SG  1 ribosomal RNA  96.97 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000030846  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0380  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 109 bp  58  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0833  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 109 bp  58  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0028  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0420198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0018  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0005  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0050  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 120 bp  56  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0026  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 120 bp  56  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0057  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0009  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0008  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0003  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000187832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0068  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0042  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.488998  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0054  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000257756  decreased coverage  0.000469584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0003  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.73811e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r1370  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 36 bp  50.1  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr03  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 103 bp  50.1  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr06  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0048  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 111 bp  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1832  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 89 bp  50.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.172239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0053  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 111 bp  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0282002  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1705  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 89 bp  50.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0166  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 89 bp  50.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r0656  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 36 bp  50.1  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.757563  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0022  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 89 bp  50.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0005  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.52738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0016  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0092  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.214269  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0076  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0059  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 205 bp  44.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0052  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0049  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0033  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0027  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 205 bp  44.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.866898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0020  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0018  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0005  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 117 bp  44.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>