39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0891 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0891  putative glucose uptake permease  100 
 
 
295 aa  574  1.0000000000000001e-163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000919677  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2601  putative glucose uptake permease  90.8 
 
 
261 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2157  transporter, putative  56.18 
 
 
278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000281775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0184  sugar transport family protein  41.72 
 
 
283 aa  222  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5101  putative transporter  42.07 
 
 
283 aa  222  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0200  transporter  42.96 
 
 
283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0219  putative transporter  42.76 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0198  sugar transport family protein  41.03 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0242  putative transporter  42.76 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0225  putative transporter  42.76 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0190  glucose uptake protein  42.76 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0187  glucose uptake protein  42.76 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0200  transporter  42.76 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0220  glucose uptake protein  42.76 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0407  glucose uptake protein  37.93 
 
 
285 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4829  glucose uptake protein  37.93 
 
 
285 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4853  glucose uptake protein  37.59 
 
 
285 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4859  glucose uptake protein  37.93 
 
 
285 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4969  glucose uptake protein  37.93 
 
 
285 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4613  glucose uptake protein  37.93 
 
 
285 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4835  glucose uptake protein  37.59 
 
 
285 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4467  glucose uptake protein  37.93 
 
 
285 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4449  glucose uptake protein  36.9 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4548  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  37.72 
 
 
285 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1714  putative glucose uptake permease  38.83 
 
 
315 aa  182  7e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3389  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  34.83 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0471  putative glucose uptake permease  36.13 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000523457  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0031  sugar transport family protein  35.52 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000014774  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0367  glucose uptake protein  34.02 
 
 
251 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316685  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2283  sugar transport family protein  35.29 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2324  sugar transport family protein  35.29 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0418  sugar transport family protein  35.07 
 
 
286 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1838  sugar transporter, putative  33.95 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00199783  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0172  putative glucose uptake permease  30 
 
 
287 aa  123  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013856  hitchhiker  4.93934e-16 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0255  sugar transport family protein  30.46 
 
 
293 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0261  sugar transport family protein  30.46 
 
 
293 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1040  ribose transport protein  29.39 
 
 
296 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2102  hypothetical protein  27.76 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0662  sugar transport family protein  25.72 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>