39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2601 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2601  putative glucose uptake permease  100 
 
 
261 aa  509  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0891  putative glucose uptake permease  90.8 
 
 
295 aa  442  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000919677  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2157  transporter, putative  57.92 
 
 
278 aa  264  8.999999999999999e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000281775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0184  sugar transport family protein  42.08 
 
 
283 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5101  putative transporter  42.08 
 
 
283 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4829  glucose uptake protein  40.31 
 
 
285 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0407  glucose uptake protein  40.31 
 
 
285 aa  198  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4859  glucose uptake protein  39.92 
 
 
285 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4853  glucose uptake protein  39.92 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4613  glucose uptake protein  39.92 
 
 
285 aa  195  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4969  glucose uptake protein  39.92 
 
 
285 aa  195  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4835  glucose uptake protein  39.53 
 
 
285 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0200  transporter  42.86 
 
 
283 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0242  putative transporter  42.86 
 
 
283 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0187  glucose uptake protein  42.86 
 
 
283 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0225  putative transporter  42.86 
 
 
283 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0220  glucose uptake protein  42.86 
 
 
283 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0190  glucose uptake protein  42.86 
 
 
283 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0219  putative transporter  42.86 
 
 
283 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0200  transporter  42.86 
 
 
283 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0198  sugar transport family protein  40.54 
 
 
283 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4467  glucose uptake protein  39.92 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4449  glucose uptake protein  39.15 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4548  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  39.3 
 
 
285 aa  181  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3389  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  35.74 
 
 
285 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0471  putative glucose uptake permease  34.41 
 
 
321 aa  145  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000523457  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1714  putative glucose uptake permease  36.3 
 
 
315 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0367  glucose uptake protein  35.38 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0031  sugar transport family protein  35.41 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000014774  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0418  sugar transport family protein  36.86 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1838  sugar transporter, putative  35 
 
 
287 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00199783  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2324  sugar transport family protein  34.55 
 
 
287 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2283  sugar transport family protein  34.55 
 
 
287 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0172  putative glucose uptake permease  32.16 
 
 
287 aa  124  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013856  hitchhiker  4.93934e-16 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0261  sugar transport family protein  29.63 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0255  sugar transport family protein  29.63 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2102  hypothetical protein  29.06 
 
 
293 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1040  ribose transport protein  28.57 
 
 
296 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0662  sugar transport family protein  26.47 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>