39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0031 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0031  sugar transport family protein  100 
 
 
287 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000014774  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0418  sugar transport family protein  67.48 
 
 
286 aa  391  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0172  putative glucose uptake permease  37.37 
 
 
287 aa  177  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013856  hitchhiker  4.93934e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4853  glucose uptake protein  34.71 
 
 
285 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0407  glucose uptake protein  35.74 
 
 
285 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4829  glucose uptake protein  35.05 
 
 
285 aa  158  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1714  putative glucose uptake permease  35.83 
 
 
315 aa  157  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4859  glucose uptake protein  34.71 
 
 
285 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4613  glucose uptake protein  34.71 
 
 
285 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4969  glucose uptake protein  34.71 
 
 
285 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4835  glucose uptake protein  34.36 
 
 
285 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4548  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  35.19 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4449  glucose uptake protein  34.81 
 
 
285 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5101  putative transporter  34.51 
 
 
283 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0184  sugar transport family protein  34.51 
 
 
283 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4467  glucose uptake protein  34.44 
 
 
285 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0891  putative glucose uptake permease  35.27 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000919677  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1040  ribose transport protein  35.37 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3389  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  34.2 
 
 
285 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0200  transporter  34.51 
 
 
283 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0225  putative transporter  34.51 
 
 
283 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0187  glucose uptake protein  34.51 
 
 
283 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0242  putative transporter  34.51 
 
 
283 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0219  putative transporter  34.51 
 
 
283 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0190  glucose uptake protein  34.51 
 
 
283 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0220  glucose uptake protein  34.51 
 
 
283 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0200  transporter  34.52 
 
 
283 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0198  sugar transport family protein  33.45 
 
 
283 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0255  sugar transport family protein  33.45 
 
 
293 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0261  sugar transport family protein  33.45 
 
 
293 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2157  transporter, putative  35.64 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000281775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2324  sugar transport family protein  35.53 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2283  sugar transport family protein  35.53 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0471  putative glucose uptake permease  30.65 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000523457  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2601  putative glucose uptake permease  35.14 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2102  hypothetical protein  32.49 
 
 
293 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1838  sugar transporter, putative  33.33 
 
 
287 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00199783  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0367  glucose uptake protein  33.19 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316685  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0662  sugar transport family protein  21.65 
 
 
296 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>