38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2102 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2102  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  564  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0261  sugar transport family protein  76.79 
 
 		 293 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0255  sugar transport family protein  76.79 
 
 		 293 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1040  ribose transport protein  65.2 
 
 		 296 aa  384  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0418  sugar transport family protein  36.43 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0172  putative glucose uptake permease  38.16 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013856  hitchhiker  4.93934e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4613  glucose uptake protein  35.99 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4969  glucose uptake protein  35.99 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0407  glucose uptake protein  35.64 
 
 		 285 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4859  glucose uptake protein  35.64 
 
 		 285 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4829  glucose uptake protein  35.29 
 
 		 285 aa  148  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4853  glucose uptake protein  35.64 
 
 		 285 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4835  glucose uptake protein  35.29 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4548  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  34.91 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4467  glucose uptake protein  35.87 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4449  glucose uptake protein  35.87 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0031  sugar transport family protein  32.64 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000014774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3389  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  34.91 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5101  putative transporter  33.45 
 
 		 283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0184  sugar transport family protein  33.81 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0198  sugar transport family protein  33.45 
 
 		 283 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2283  sugar transport family protein  32.13 
 
 		 287 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2324  sugar transport family protein  32.13 
 
 		 287 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0200  transporter  33.81 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0242  putative transporter  33.81 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0187  glucose uptake protein  33.81 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0190  glucose uptake protein  33.81 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0225  putative transporter  33.81 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0220  glucose uptake protein  33.81 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0219  putative transporter  33.81 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0200  transporter  33.57 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1838  sugar transporter, putative  32.12 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00199783  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0367  glucose uptake protein  36.11 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316685  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1714  putative glucose uptake permease  29.64 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0471  putative glucose uptake permease  26.92 
 
 		 321 aa  98.2  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000523457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0891  putative glucose uptake permease  27.61 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000919677  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2157  transporter, putative  28.98 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000281775  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2601  putative glucose uptake permease  28.68 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>