40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2952 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2952  prophage LambdaSo, minor tail protein M, putative  100 
 
 		 111 aa  229  9e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2582  minor tail family protein  86.49 
 
 		 111 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.509278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2418  phage minor tail protein  51.38 
 
 		 112 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0502911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2779  Phage minor tail  46.79 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00996028  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2224  phage minor tail family protein  47.71 
 
 		 112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3932  minor tail family protein  44.04 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1691  phage HK97 GP17-like protein  46.79 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.294427  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3100  minor tail family protein  45.05 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.033574  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1057  Phage minor tail protein  42.73 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0742722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1689  Phage minor tail protein  42.73 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3877  minor tail family protein  41.07 
 
 		 112 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266915  normal  0.28398 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2201  phage minor tail protein  43.24 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1637  Phage minor tail protein  39.25 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0781  hypothetical protein  34.21 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08250  hypothetical protein  34.21 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222375 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0450  LambdaSo, minor tail protein M  37.04 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0159877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1417  phage minor tail protein  32.11 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0253918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1152  phage minor tail protein  32.11 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1080  phage minor tail protein  31.19 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2105  minor tail family protein  33.04 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000552364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00746  hypothetical protein  33.04 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10050  tail component  33.04 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1468  phage minor tail protein  37.66 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1883  phage minor tail  34.65 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1634  phage minor tail protein  33.04 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.155069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3193  phage minor tail protein  29.82 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3125  phage minor tail protein  29.82 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0375615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1873  phage minor tail protein  29.82 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1797  phage minor tail protein  29.82 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1196  phage minor tail protein  29.82 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2767  phage minor tail protein  29.82 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.805166 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0704  phage minor tail protein  26.42 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2800  phage minor tail protein  26.42 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0884  phage minor tail protein  28.95 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0090  phage minor tail protein  28.97 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0909  phage minor tail protein  26.85 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1199  phage minor tail protein  26.13 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0659  phage minor tail protein  29.82 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000282073 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3386  minor tail family protein  26.55 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36986  hitchhiker  0.000000000407319 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5471  hypothetical protein  28.85 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>