20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2467 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2467  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  343  8e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.206216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2504  hypothetical protein  94.01 
 
 		 168 aa  306  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0045  hypothetical protein  94.01 
 
 		 168 aa  306  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0045  hypothetical protein  94.01 
 
 		 168 aa  306  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2963  hypothetical protein  33.78 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5791  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5473  hypothetical protein  29.53 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5873  hypothetical protein  29.53 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3746  hypothetical protein  25.85 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4033  hypothetical protein  22.44 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.773314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2991  conserved hypothetical protein DUF1643  23.23 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2772  hypothetical protein  23.13 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1110  hypothetical protein  23.13 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3032  protein of unknown function DUF1643  27.52 
 
 		 337 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234736  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2920  hypothetical protein  21.94 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2367  hypothetical protein  29.92 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1928  hypothetical protein  24.67 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00260784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1464  hypothetical protein  28.23 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0120527  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1804  hypothetical protein  25.78 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2474  protein of unknown function DUF1643  26.09 
 
 		 186 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>