38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1838 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1838  sugar transporter, putative  100 
 
 		 287 aa  549  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00199783  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2324  sugar transport family protein  83.83 
 
 		 287 aa  447  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2283  sugar transport family protein  83.83 
 
 		 287 aa  447  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4613  glucose uptake protein  51.76 
 
 		 285 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4969  glucose uptake protein  51.76 
 
 		 285 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4853  glucose uptake protein  51.76 
 
 		 285 aa  278  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0407  glucose uptake protein  51.76 
 
 		 285 aa  278  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4829  glucose uptake protein  51.76 
 
 		 285 aa  278  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4859  glucose uptake protein  51.41 
 
 		 285 aa  277  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4835  glucose uptake protein  51.06 
 
 		 285 aa  275  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3389  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  55.51 
 
 		 285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4548  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  52.65 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4449  glucose uptake protein  52.27 
 
 		 285 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4467  glucose uptake protein  51.14 
 
 		 285 aa  265  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0367  glucose uptake protein  51.03 
 
 		 251 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5101  putative transporter  43.31 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0184  sugar transport family protein  42.61 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0198  sugar transport family protein  43.31 
 
 		 283 aa  215  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0225  putative transporter  42.61 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0190  glucose uptake protein  42.61 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0187  glucose uptake protein  42.61 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0242  putative transporter  42.61 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0200  transporter  42.61 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0219  putative transporter  42.61 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0220  glucose uptake protein  42.61 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0200  transporter  42.7 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1714  putative glucose uptake permease  36.33 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0471  putative glucose uptake permease  36.1 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000523457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0891  putative glucose uptake permease  33.33 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000919677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0261  sugar transport family protein  32.06 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0255  sugar transport family protein  32.06 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0031  sugar transport family protein  34.39 
 
 		 287 aa  132  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000014774  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2157  transporter, putative  34.18 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000281775  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0418  sugar transport family protein  32.87 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2601  putative glucose uptake permease  34.58 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0172  putative glucose uptake permease  31.18 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013856  hitchhiker  4.93934e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1040  ribose transport protein  31.27 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2102  hypothetical protein  32.58 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>