23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0717 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0717  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  377  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000615764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1208  hypothetical protein  75.68 
 
 
185 aa  298  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000132249  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1186  hypothetical protein  75.68 
 
 
185 aa  298  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000152824  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1005  protein of unknown function DUF177  34.04 
 
 
181 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1877  protein of unknown function DUF177  31.02 
 
 
179 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2574  hypothetical protein  31.35 
 
 
166 aa  92.8  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000736342  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1230  hypothetical protein  34.04 
 
 
185 aa  92  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000525482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3939  hypothetical protein  28.8 
 
 
166 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3977  hypothetical protein  28.8 
 
 
166 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4063  hypothetical protein  28.8 
 
 
166 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000072434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3666  hypothetical protein  28.8 
 
 
166 aa  92  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.580310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3775  hypothetical protein  28.8 
 
 
166 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000007922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3970  hypothetical protein  28.8 
 
 
166 aa  92  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000472322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3683  hypothetical protein  28.8 
 
 
166 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4025  hypothetical protein  28.8 
 
 
166 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1216  hypothetical protein  28.8 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000247083  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3751  hypothetical protein  28.26 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000323099  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1733  metal-binding protein  28.49 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0591204  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0913  metal-binding protein  25.93 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110211  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1702  hypothetical protein  26.16 
 
 
176 aa  54.7  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000128293  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0353  hypothetical protein  22.1 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00152246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1805  hypothetical protein  24.34 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2612  hypothetical protein  23.68 
 
 
182 aa  41.2  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.801895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>