28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1230 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1230  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  377  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000525482  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1733  metal-binding protein  39.78 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0591204  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0913  metal-binding protein  33.33 
 
 
181 aa  104  8e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110211  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0353  hypothetical protein  35.37 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00152246  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1208  hypothetical protein  32.63 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000132249  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1186  hypothetical protein  32.63 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000152824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1877  protein of unknown function DUF177  32.07 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1702  hypothetical protein  36.75 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000128293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3939  hypothetical protein  33.15 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4063  hypothetical protein  33.15 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000072434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3977  hypothetical protein  33.15 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3666  hypothetical protein  33.15 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.580310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3970  hypothetical protein  33.15 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000472322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3775  hypothetical protein  33.15 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000007922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2574  hypothetical protein  32.58 
 
 
166 aa  92  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000736342  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0717  hypothetical protein  34.04 
 
 
184 aa  92  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000615764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4025  hypothetical protein  33.15 
 
 
166 aa  92  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3683  hypothetical protein  33.15 
 
 
166 aa  92  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1216  hypothetical protein  33.15 
 
 
166 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000247083  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1399  metal-binding protein, inactivated metal-binding site  29.73 
 
 
182 aa  87  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000762382  hitchhiker  7.860250000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3751  hypothetical protein  31.46 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000323099  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1626  hypothetical protein  30.3 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.219267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1005  protein of unknown function DUF177  29.32 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1694  hypothetical protein  19.86 
 
 
131 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1258  protein of unknown function DUF177  28.77 
 
 
173 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000135148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1976  hypothetical protein  20.42 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2079  hypothetical protein  23.57 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1596  hypothetical protein  26.72 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.3780500000000002e-18  normal  0.312319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>