176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0893 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0893  BolA family protein  100 
 
 
80 aa  167  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0866848 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1597  BolA family protein  90 
 
 
80 aa  153  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0816624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2952  BolA-like protein  88.75 
 
 
80 aa  151  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1391  BolA family protein  83.75 
 
 
80 aa  141  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45441  normal  0.295987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2172  BolA-like protein  68.75 
 
 
78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1117  BolA-like protein  68.75 
 
 
78 aa  110  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1712  hypothetical protein  69.62 
 
 
77 aa  110  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1309  BolA-like protein  62.5 
 
 
77 aa  103  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1637  BolA-like protein  62.5 
 
 
77 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1276  BolA-like protein  61.25 
 
 
77 aa  100  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2390  BolA family protein  60 
 
 
77 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2145  BolA family protein  58.75 
 
 
77 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230515  normal  0.346751 
 
 
-
 
NC_004310  BR0836  bolA-related protein  60 
 
 
77 aa  97.8  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0828  bolA-related protein  60 
 
 
77 aa  97.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.775984  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0864  BolA family protein  62.03 
 
 
77 aa  97.1  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4711  BolA family protein  56.25 
 
 
77 aa  97.1  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1935  BolA family protein  58.75 
 
 
77 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1755  BolA-like protein  57.5 
 
 
78 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0356  BolA-like protein  56.96 
 
 
77 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2666  BolA family protein  53.75 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.306779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3710  BolA-like protein  56.25 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778992  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1594  BolA-like protein  57.5 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1789  BolA family protein  56.25 
 
 
78 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1506  BolA family protein  57.5 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935248  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0186  BolA family protein  53.75 
 
 
78 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.49621  normal  0.367892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5397  hypothetical protein  56.25 
 
 
79 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178192  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1939  BolA/YrbA family protein  56.25 
 
 
78 aa  93.6  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4089  BolA family protein  53.75 
 
 
77 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0009  BolA family protein  54.43 
 
 
78 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1023  BolA family protein  58.75 
 
 
77 aa  89.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15015  normal  0.871114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5884  hypothetical protein  55.7 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206517  normal  0.559405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0707  BolA-like protein  56.25 
 
 
77 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2520  BolA-like protein  52.5 
 
 
77 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0006  BolA family protein  50.63 
 
 
78 aa  87  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0011  BolA family protein  50.63 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0124  BolA family protein  49.37 
 
 
77 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2585  BolA family protein  54.43 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6655  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0013  BolA family protein  50.63 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0874253  normal  0.885333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0012  BolA family protein  50.63 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1126  BolA family protein  49.37 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3118  BolA family protein  51.9 
 
 
77 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1185  BolA family protein  48.1 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.234576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3464  BolA family protein  46.84 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296353  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0303  BolA family protein  43.33 
 
 
73 aa  63.5  0.0000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.321518  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09531  BolA-like protein  35.9 
 
 
77 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.336163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  38.46 
 
 
85 aa  61.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0263  BolA family protein  37.18 
 
 
80 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0466064  normal  0.451976 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0700  BolA-like protein  40 
 
 
76 aa  60.5  0.000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.088559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  37.33 
 
 
80 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1417  BolA family protein  35.62 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.415851  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2783  BolA family protein  36 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0490  hypothetical protein  35.53 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.529866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  35.06 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  35.06 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10771  BolA-like protein  37.68 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.42913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  33.77 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0676  BolA family protein  44.3 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  38.57 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  32.47 
 
 
81 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  37.66 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  41.03 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0640  BolA-like protein  36.36 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1660  BolA family protein  34.72 
 
 
82 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168769  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  37.66 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14721  BolA-like protein  36.36 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0966227  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  37.97 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  36.36 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0762  hypothetical protein  43.04 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  37.66 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  37.66 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  37.66 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  37.66 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  37.66 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  37.66 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  37.66 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  37.66 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5266  BolA family protein  36 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11515 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  36 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  37.66 
 
 
82 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  36.36 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12171  BolA-like protein  35.14 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  35.06 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  35.06 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2781  BolA-like protein  33.77 
 
 
75 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  41.03 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  29.87 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1121  BolA-like protein  33.33 
 
 
76 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  32.47 
 
 
85 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1611  BolA family protein  35.53 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  37.97 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  37.18 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  43.64 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  32.47 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  43.4 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  36.71 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  33.77 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1822  BolA family protein  34.18 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0500  BolA family protein  35.44 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  35.44 
 
 
83 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>