13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0029 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0029  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  223  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.935887  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2965  hypothetical protein  83.33 
 
 
108 aa  193  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0666  hypothetical protein  83.33 
 
 
108 aa  191  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1474  hypothetical protein  70.37 
 
 
108 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0189649  normal  0.295574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1992  hypothetical protein  65.74 
 
 
108 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429225  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6537  hypothetical protein  62.96 
 
 
108 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239375  normal  0.157603 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7233  hypothetical protein  62.96 
 
 
108 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5689  hypothetical protein  60.19 
 
 
108 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6053  hypothetical protein  60.19 
 
 
108 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.635016  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4918  hypothetical protein  53.7 
 
 
108 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4399  hypothetical protein  50.93 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0865047 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1884  hypothetical protein  47.22 
 
 
108 aa  100  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1411  hypothetical protein  34.57 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.380546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>