More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0775 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  100 
 
 
309 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  84.15 
 
 
281 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0185  phosphonate ABC transporter ATP-binding  64.36 
 
 
293 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  64.15 
 
 
288 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  64.34 
 
 
296 aa  332  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  66.02 
 
 
284 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  60.3 
 
 
301 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  61.15 
 
 
307 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  58.24 
 
 
280 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  59.56 
 
 
307 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  59.56 
 
 
307 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  59.56 
 
 
307 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  59.56 
 
 
307 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  59.56 
 
 
307 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  59.56 
 
 
307 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  62 
 
 
307 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4623  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  59.3 
 
 
269 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.263735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  60.78 
 
 
277 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  60.78 
 
 
277 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  59.61 
 
 
278 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  59.84 
 
 
274 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  56.99 
 
 
278 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  57.54 
 
 
262 aa  278  7e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  57.14 
 
 
262 aa  276  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  57.14 
 
 
262 aa  276  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  57.14 
 
 
262 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  57.14 
 
 
262 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  57.14 
 
 
262 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  57.14 
 
 
262 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  56.75 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  57.6 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  54.94 
 
 
264 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0259  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  51.7 
 
 
270 aa  256  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  51.18 
 
 
267 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  51.18 
 
 
267 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3862  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  48.03 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  46.82 
 
 
269 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.07 
 
 
270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3324  ATPase  43.36 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
267 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2878  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.39 
 
 
278 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.55 
 
 
254 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  43.85 
 
 
271 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2799  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.39 
 
 
278 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1345  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  40.39 
 
 
278 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0502345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 
261 aa  209  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.56 
 
 
272 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  42.04 
 
 
261 aa  206  3e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.28 
 
 
275 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.26 
 
 
256 aa  202  4e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1410  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 
277 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  43.63 
 
 
270 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  42.19 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  40.08 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.27 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.27 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.35 
 
 
261 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
257 aa  198  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.2 
 
 
281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.06 
 
 
264 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.2 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  41.03 
 
 
274 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.6 
 
 
282 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.22 
 
 
273 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
264 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  43.25 
 
 
259 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.62 
 
 
257 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  40.35 
 
 
287 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0894  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.45 
 
 
275 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  39.23 
 
 
257 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 
257 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  39.23 
 
 
257 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 
257 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000015251 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 
257 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 
257 aa  191  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6364  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 
275 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.857375 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.18 
 
 
310 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2285  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000778372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  47.28 
 
 
269 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1321  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 
271 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  40.8 
 
 
272 aa  189  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3264  hypothetical protein  41.13 
 
 
273 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 
279 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.9 
 
 
260 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  34.8 
 
 
249 aa  186  4e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 
252 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  39.84 
 
 
272 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1319  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 
278 aa  185  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2010  phosphonates import ATP-binding protein  38.46 
 
 
265 aa  185  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.194756  normal  0.0179512 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0377  ABC transporter related  42.8 
 
 
261 aa  185  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.308685  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2683  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.52 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0052985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3372  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.24 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4787  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.73 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334656  normal  0.0646281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.33 
 
 
261 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 
300 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3258  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.55 
 
 
272 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617138  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  39.44 
 
 
266 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>