271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0827 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 460 aa  935    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  68.04 
 
 		 453 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  68.04 
 
 		 453 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  66.28 
 
 		 452 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2760  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.57 
 
 		 449 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.82 
 
 		 451 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0775  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.82 
 
 		 451 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.59 
 
 		 451 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0625  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.96 
 
 		 453 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5927  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.54 
 
 		 459 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.78 
 
 		 457 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.275384  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6179  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.68 
 
 		 458 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.5 
 
 		 445 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1985  nicotinate phosphoribosyltransferase  54.32 
 
 		 447 aa  435  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000236264  hitchhiker  0.00837081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.45 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1780  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.25 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0122  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.42 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 		 460 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2602  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.35 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  48.07 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1215  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.49 
 
 		 451 aa  381  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10583  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.127794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.03 
 
 		 462 aa  358  8e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  48.09 
 
 		 451 aa  345  8.999999999999999e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0320218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2646  nicotinate phosphoribosyltransferase  47.84 
 
 		 450 aa  330  4e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159209  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 		 485 aa  322  6e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2289  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.05 
 
 		 481 aa  316  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2236  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.605686 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.68 
 
 		 476 aa  310  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0293  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.38 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0271  nicotinate phosphoribosyltransferase  46.1 
 
 		 451 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4911  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.99 
 
 		 489 aa  299  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489735  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2253  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.55 
 
 		 484 aa  299  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1758  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.95 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1964  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.7 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0253491  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1011  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.44 
 
 		 468 aa  296  5e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.2 
 
 		 468 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0271  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.27 
 
 		 451 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.46 
 
 		 488 aa  292  7e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0113  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3836  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.12 
 
 		 485 aa  290  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0322574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0414  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.08 
 
 		 459 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 		 491 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0528  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.46 
 
 		 498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.633345  unclonable  0.0000000475164 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2627  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.9 
 
 		 489 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3666  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 		 495 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335827  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1046  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.5 
 
 		 489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3220  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.13 
 
 		 458 aa  286  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 		 490 aa  286  8e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0632  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.24 
 
 		 505 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.037982 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.43 
 
 		 489 aa  283  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.43 
 
 		 489 aa  283  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0344  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 		 467 aa  282  9e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0322  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 		 467 aa  282  9e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5746  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.75 
 
 		 523 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  35.41 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0996  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.61 
 
 		 501 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0354541  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0273  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.93 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.89 
 
 		 489 aa  280  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.532365  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1071  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.64 
 
 		 483 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000207171  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0318  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.69 
 
 		 459 aa  277  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 		 487 aa  277  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0295  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.79 
 
 		 486 aa  276  6e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.96 
 
 		 486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.914728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2987  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.43 
 
 		 479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.06 
 
 		 480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.56 
 
 		 487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000067551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.56 
 
 		 487 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.56 
 
 		 487 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.44 
 
 		 487 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 		 487 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 		 487 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.44 
 
 		 487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.72 
 
 		 487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.96 
 
 		 487 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1540  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 480 aa  270  5e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 486 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0174  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 478 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0227  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 		 456 aa  267  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3722  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.58 
 
 		 491 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1202  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 		 490 aa  266  8e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0281  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 		 456 aa  266  8.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.168647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3805  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.36 
 
 		 491 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.17 
 
 		 487 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0255  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.53 
 
 		 456 aa  265  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3792  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  39.69 
 
 		 491 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3664  nicotinate phosphoribosyltransferase related  39.24 
 
 		 491 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.211664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1417  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.4 
 
 		 490 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414202  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1180  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.690233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1227  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.2 
 
 		 490 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.507813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16160  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.14 
 
 		 486 aa  256  8e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1148  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.79 
 
 		 486 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.24916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09180  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  37.4 
 
 		 489 aa  249  8e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.346116 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0890  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1692  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.23 
 
 		 443 aa  234  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  hitchhiker  0.00000832621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2863  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 454 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0781042  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0655  nicotinate phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 		 481 aa  231  2e-59  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0933  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.570353  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1693  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0334582  normal  0.146455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>