34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1082 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1082  NifQ  100 
 
 		 235 aa  476  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0978  NifQ  83.9 
 
 		 236 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789318  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5092  NifQ family protein  80.37 
 
 		 236 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4454  NifQ  66.67 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5878  putative nitrogen fixation protein nifQ  64.85 
 
 		 245 aa  248  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3543  NifQ family protein  56.1 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  0.0106924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3988  NifQ family protein  50.56 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152989  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1561  NifQ family protein  51.43 
 
 		 205 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2281  NifQ  40.72 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0482  NifQ family protein  39 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3623  NifQ family protein  38.2 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0097  NifQ family protein  40.94 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0280  NifQ family protein  39.16 
 
 		 197 aa  121  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239171  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1254  NifQ family protein  51.89 
 
 		 179 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1229  NifQ family protein  34.33 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411993  hitchhiker  0.000327606 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1511  nitrogen fixation protein NifQ  34.33 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.203705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1448  NifQ  37.72 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2185  NifQ family protein  41.25 
 
 		 179 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.149657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1209  NifQ family protein  40 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0239  nitrogen fixation protein nifQ, putative  37.5 
 
 		 197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.305155  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0533  putative nitrogen fixation protein nifQ  39.38 
 
 		 179 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.057616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0315  NifU-like protein  34.92 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000902631  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1355  NifQ family protein  34.2 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51040  Nitrogen fixation cofactor assembly protein  38.41 
 
 		 195 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0404512  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7734  NifQ family protein  35.29 
 
 		 192 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2319  NifQ family protein  42.53 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00231718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1476  putative nitrogen fixation-related protein(NifQ)  34.46 
 
 		 192 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000951053 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0514  NifQ family protein  36.89 
 
 		 170 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4126  putative nitrogen fixation protein NifQ  39.53 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.850177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5817  hypothetical protein  34.48 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0755025  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6182  NifQ family protein  34.48 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6662  NifQ family protein  33.79 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0612725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7727  hypothetical protein  38.75 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6153  NifQ family protein  36.25 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.16118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>