18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1182 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1182  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5112  hypothetical protein  36.34 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2629  hypothetical protein  29.3 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  28.86 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51690  hypothetical protein  40.37 
 
 		 120 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00189742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  36.25 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2516  hypothetical protein  30.84 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0713675  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1131  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.07 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  46.3 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2211  protein of unknown function DUF559  33.33 
 
 		 122 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2274  protein of unknown function DUF559  33.33 
 
 		 122 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0690835  hitchhiker  0.00000422818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  35.82 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2841  protein of unknown function DUF559  33.71 
 
 		 148 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00016732  normal  0.493476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0914  hypothetical protein  32.88 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  26.57 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  35.29 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3525  hypothetical protein  35.71 
 
 		 123 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.739621  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0029  hypothetical protein  32.32 
 
 		 128 aa  42.7  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>