27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1345 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  100 
 
 		 338 aa  703    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  68.05 
 
 		 338 aa  482  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  42.95 
 
 		 322 aa  262  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  38.86 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  36.53 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  34.59 
 
 		 303 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  35.19 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  30.58 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  31.52 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  31.15 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  33.13 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  31.58 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  32.5 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  30.41 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  30.43 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  31.79 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  30.07 
 
 		 300 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  31.38 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  31.04 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  36.11 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  30.58 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0373  Phage-related protein endonuclease-like protein  40.43 
 
 		 136 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3048  phage-related protein predicted endonuclease-like protein  27.2 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.0334909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  25.25 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  27.84 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0591  hypothetical protein  29.61 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  28.5 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>