12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0871 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0871  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0831  hypothetical protein  94.2 
 
 		 243 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0858  hypothetical protein  94.69 
 
 		 207 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290752  normal  0.638317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4357  hypothetical protein  86.54 
 
 		 207 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.237177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3400  trypsin-like serine protease  38.37 
 
 		 406 aa  48.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0421  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34 
 
 		 406 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  59.38 
 
 		 471 aa  43.1  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  59.38 
 
 		 471 aa  43.1  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  64.29 
 
 		 524 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.41 
 
 		 484 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.41 
 
 		 483 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.41 
 
 		 481 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>