More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2489 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2489  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
463 aa  948    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2158  aldehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
462 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.734921  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2085  Aldehyde Dehydrogenase_  61.47 
 
 
454 aa  548  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1754  aldehyde dehydrogenase  60.85 
 
 
480 aa  519  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0300  aldehyde dehydrogenase  56.26 
 
 
458 aa  511  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0223565  hitchhiker  0.0000134902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  54.55 
 
 
469 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.604526  decreased coverage  0.00230582 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1918  Aldehyde Dehydrogenase  52.27 
 
 
475 aa  481  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3615  aldehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
460 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.30982  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0165  Aldehyde Dehydrogenase  46.29 
 
 
459 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0486514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2358  aldehyde Dehydrogenase  44.94 
 
 
461 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2181  Aldehyde Dehydrogenase  47.51 
 
 
456 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00587  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
468 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2652  aldehyde dehydrogenase  45.84 
 
 
459 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0489  aldehyde dehydrogenase  47.99 
 
 
459 aa  422  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0498787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0449  Aldehyde Dehydrogenase  46.05 
 
 
456 aa  418  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21711  putative aldehyde dehydrogenase  47.02 
 
 
459 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0450332 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0334  Aldehyde Dehydrogenase  46.64 
 
 
465 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2512  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  42.53 
 
 
457 aa  413  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00297812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14840  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  47.4 
 
 
481 aa  411  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0170872  normal  0.129561 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0497  putative aldehyde dehydrogenase  45.92 
 
 
459 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0365666 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4713  aldehyde dehydrogenase  41.78 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0080  aldehyde dehydrogenase  44.79 
 
 
470 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2610  aldehyde dehydrogenase  43.18 
 
 
458 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.514086  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2296  aldehyde dehydrogenase  43.18 
 
 
458 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.69034  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03681  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
449 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.975414  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1456  aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 
459 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.133276  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  45.13 
 
 
481 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0090  aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 
470 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0099  aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 
470 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3041  aldehyde dehydrogenase  40.22 
 
 
461 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1200  aldehyde dehydrogenase  47.27 
 
 
455 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1838  putative aldehyde dehydrogenase  43.2 
 
 
459 aa  385  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1397  aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 
455 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1176  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  46 
 
 
455 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1438  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.59 
 
 
455 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1709  putative aldehyde dehydrogenase  41.28 
 
 
459 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0791372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1374  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.77 
 
 
455 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1965  Aldehyde Dehydrogenase  45.35 
 
 
468 aa  378  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1198  aldehyde dehydrogenase  45.54 
 
 
455 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1178  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  46 
 
 
455 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.198851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4008  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.14 
 
 
455 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.148119  hitchhiker  0.00000000000192548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0105  aldehyde dehydrogenase  42.63 
 
 
470 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1296  aldehyde dehydrogenase  45.54 
 
 
455 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04241  putative aldehyde dehydrogenase  41.28 
 
 
459 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.844488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0742  aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 
468 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1930  Aldehyde Dehydrogenase  48.96 
 
 
480 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1336  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.68 
 
 
455 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2010  aldehyde dehydrogenase  41.43 
 
 
459 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1977  aldehyde dehydrogenase  41.43 
 
 
459 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.205682  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0078  aldehyde dehydrogenase  44.14 
 
 
474 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2479  Aldehyde Dehydrogenase  41.33 
 
 
469 aa  368  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.410895  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08936  aldehyde dehydrogenase  39.54 
 
 
457 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.539716  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5442  aldehyde dehydrogenase  43.67 
 
 
486 aa  364  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274338  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0238  aldehyde dehydrogenase  44.14 
 
 
474 aa  362  6e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851453  decreased coverage  0.000681524 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1006  aldehyde dehydrogenase  46.14 
 
 
454 aa  359  6e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01050  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 
504 aa  351  2e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.958772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1742  Aldehyde Dehydrogenase  41.63 
 
 
476 aa  350  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4268  Aldehyde Dehydrogenase  41.22 
 
 
462 aa  349  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0821  Aldehyde Dehydrogenase  43.99 
 
 
475 aa  349  5e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0672695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2364  aldehyde dehydrogenase  44.57 
 
 
475 aa  349  7e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0648683  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0337  putative aldehyde dehydrogenase  37.22 
 
 
463 aa  342  7e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.704736  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10148  aldehyde dehydrogenase  42.14 
 
 
506 aa  341  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03571  putative aldehyde dehydrogenase  37.64 
 
 
463 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03581  putative aldehyde dehydrogenase  37.41 
 
 
463 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.995721  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1254  aldehyde dehydrogenase  44.95 
 
 
471 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38059  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0438  aldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
484 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0433999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0607  aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
484 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549994  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0440  aldehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
483 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461443  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0503  Aldehyde Dehydrogenase  39.33 
 
 
456 aa  327  3e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.958957  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03631  putative aldehyde dehydrogenase  37.16 
 
 
463 aa  325  9e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0388  hypothetical protein  38.32 
 
 
447 aa  323  4e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0861429  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2238  aldehyde dehydrogenase  39.01 
 
 
472 aa  322  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5303  aldehyde dehydrogenase  41.31 
 
 
485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0345  aldehyde dehydrogenase  41.92 
 
 
480 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.403687  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1294  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 
511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1085  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
490 aa  319  7e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  41.86 
 
 
477 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3846  aldehyde dehydrogenase  40.91 
 
 
477 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4460  Aldehyde Dehydrogenase  41.23 
 
 
473 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244749  hitchhiker  0.00200414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1830  aldehyde dehydrogenase  39.51 
 
 
441 aa  316  7e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2547  Aldehyde Dehydrogenase  40.09 
 
 
481 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5205  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 
498 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4064  aldehyde dehydrogenase  38.74 
 
 
479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3195  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 
496 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  36.95 
 
 
474 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  36.95 
 
 
474 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5170  aldehyde dehydrogenase  40.61 
 
 
476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  37.04 
 
 
475 aa  313  5.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0226  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.57 
 
 
472 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3683  coniferyl aldehyde dehydrogenase  36.5 
 
 
474 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 
476 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2218  aldehyde dehydrogenase  40.81 
 
 
474 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0696851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3090  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 
480 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3072  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 
480 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>