10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0085 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0085  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  293  4e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2677  hypothetical protein  38.73 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0948  hypothetical protein  43.75 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2469  hypothetical protein  46.38 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3824  hypothetical protein  34.27 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2546  hypothetical protein  45.83 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1618  hypothetical protein  29.77 
 
 
120 aa  50.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1891  hypothetical protein  43.06 
 
 
154 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2934  hypothetical protein  45.9 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2091  hypothetical protein  36.89 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>