18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2642 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2642  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3604  1-phosphatidylinositol phosphodiesterase  30.09 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00660828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3501  glycosylphosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  30.09 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000999913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3891  1-phosphatidylinositol phosphodiesterase  30.09 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3771  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  30.09 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000319022 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1438  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  30.09 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00194348  hitchhiker  0.00010452 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3532  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  30.09 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3513  glycosylphosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  30.09 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3793  1-phosphatidylinositol phosphodiesterase  30.09 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00985901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3801  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  30.09 
 
 		 329 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000171037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3860  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  30.09 
 
 		 329 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.133194  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0086  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  28.89 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5471  Phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  30.43 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.427278  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0083  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  28.89 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3757  Phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  26.96 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325914  normal  0.37365 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48445  predicted protein  29.46 
 
 		 489 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2839  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  29.85 
 
 		 822 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1585  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000890053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>