125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1310 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1310  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  180  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.46327e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2563  hypothetical protein  53.42 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1640  protein of unknown function UPF0153  48.84 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0643769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1853  hypothetical protein  43.53 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0877  hypothetical protein  51.32 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281726 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2573  protein of unknown function UPF0153  47.73 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1377  hypothetical protein  47.37 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00602542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1485  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.954662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2168  hypothetical protein  47.3 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.797575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1927  hypothetical protein  45.33 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000323397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1608  hypothetical protein  48.65 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2573  hypothetical protein  42.86 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2247  hypothetical protein  41.56 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100566  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2379  hypothetical protein  41.56 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123307  normal  0.207331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0431  hypothetical protein  47.3 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0721  protein of unknown function UPF0153  48.68 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3663  hypothetical protein  45.33 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0890  protein of unknown function UPF0153  47.3 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0887  protein of unknown function UPF0153  46.84 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0929  hypothetical protein  47.3 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0865  protein of unknown function UPF0153  47.3 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1151  hypothetical protein  47.3 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.706631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3505  hypothetical protein  45.57 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2854  hypothetical protein  43.24 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1955  hypothetical protein  45.95 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32930  hypothetical protein  47.3 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2170  hypothetical protein  40.26 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1626  hypothetical protein  44.59 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0937096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1661  protein of unknown function UPF0153  43.04 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.582941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3057  hypothetical protein  45.95 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4092  hypothetical protein  44.59 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1740  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2074  hypothetical protein  47.3 
 
 		 170 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1477  hypothetical protein  44.59 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47410  hypothetical protein  43.24 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0895733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1776  hypothetical protein  43.24 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.924435  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1432  hypothetical protein  44.59 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2819  hypothetical protein  43.24 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0879  hypothetical protein  47.3 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1340  hypothetical protein  41.89 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1790  hypothetical protein  44.59 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0377386 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1632  hypothetical protein  40.54 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000957769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1114  hypothetical protein  47.3 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95528  normal  0.301999 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1404  hypothetical protein  44.59 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2003  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.808992  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1801  hypothetical protein  43.24 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.348768  normal  0.297133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2000  hypothetical protein  38.96 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000995466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1358  hypothetical protein  38.96 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1024  hypothetical protein  44.59 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0291718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0895  hypothetical protein  44.59 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0521  hypothetical protein  42.47 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0891  hypothetical protein  43.04 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.951135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1392  hypothetical protein  40.26 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1324  hypothetical protein  43.04 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1691  hypothetical protein  40.54 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333558  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3355  hypothetical protein  40.54 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1943  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000318483  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2421  hypothetical protein  41.89 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0029814  hitchhiker  0.00169444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1871  hypothetical protein  41.89 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00350248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2368  hypothetical protein  41.89 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000024576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1898  hypothetical protein  41.89 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000382294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0898  hypothetical protein  41.89 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1905  hypothetical protein  41.89 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0367301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2239  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000027257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3918  hypothetical protein  41.56 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.871403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1567  hypothetical protein  41.56 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2978  hypothetical protein  44.59 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2070  hypothetical protein  43.24 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0978  hypothetical protein  41.33 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2197  hypothetical protein  41.33 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1667  hypothetical protein  41.89 
 
 		 158 aa  52  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000235569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2006  hypothetical protein  41.89 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0150725  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2751  hypothetical protein  40.79 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000361359  hitchhiker  0.000105732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2441  hypothetical protein  36.49 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2394  hypothetical protein  41.89 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.245355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2117  hypothetical protein  41.89 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.707271  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0453  protein of unknown function UPF0153  43.24 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.604994  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01156  hypothetical protein  41.89 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000316712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2467  protein of unknown function UPF0153  41.89 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000723255  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2303  hypothetical protein  41.33 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01166  hypothetical protein  41.89 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000198247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1767  hypothetical protein  40.54 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000753323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1301  hypothetical protein  40.26 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1087  hypothetical protein  37.18 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.999291  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1068  protein of unknown function UPF0153  39.74 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2409  hypothetical protein  43.24 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.433952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1281  hypothetical protein  41.89 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1325  hypothetical protein  41.89 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2444  hypothetical protein  41.89 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000434719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1968  hypothetical protein  41.89 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000843778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1336  hypothetical protein  41.89 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000903587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4587  hypothetical protein  40.26 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1322  hypothetical protein  41.89 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320953  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1382  hypothetical protein  40.51 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2181  hypothetical protein  36.84 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.02228  hitchhiker  0.000186068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1950  hypothetical protein  41.89 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2010  hypothetical protein  41.89 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220539  normal  0.187397 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1953  hypothetical protein  41.89 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0472193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1506  hypothetical protein  41.89 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2117  hypothetical protein  35.06 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0677538  normal  0.130665 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>