16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0034 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1111  hypothetical protein  73.73 
 
 
2656 aa  3919    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0034  hypothetical protein  100 
 
 
2661 aa  5369    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0072  hypothetical protein  69.21 
 
 
2667 aa  3728    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0064  hypothetical protein  66.06 
 
 
2676 aa  3525    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.795538 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0194  hypothetical protein  48.45 
 
 
895 aa  464  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0879  hypothetical protein  42.55 
 
 
843 aa  223  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0001  hypothetical protein  26.97 
 
 
2938 aa  144  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1304  hypothetical protein  46.55 
 
 
271 aa  139  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0490188 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2015  hypothetical protein  41.15 
 
 
215 aa  134  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000606511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0920  hypothetical protein  41.15 
 
 
210 aa  127  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0168777 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0003  hypothetical protein  41.15 
 
 
207 aa  125  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62536  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1030  hypothetical protein  41.71 
 
 
208 aa  125  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.381943 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0663  hypothetical protein  28.02 
 
 
425 aa  72.8  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1638  hypothetical protein  28.36 
 
 
445 aa  72.4  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.793073 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2124  hypothetical protein  28.44 
 
 
433 aa  57  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.782101  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0611  hypothetical protein  25.26 
 
 
422 aa  48.9  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>