14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29380 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_29380  predicted protein  100 
 
 
357 aa  745  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  8.17876e-08  normal  0.405165 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51406  predicted protein  38.26 
 
 
297 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608395  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03071  histone acetyltransferase (MysT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09610)  29.68 
 
 
363 aa  139  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.605108 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34656  predicted protein  33.83 
 
 
417 aa  134  2e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0290177  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33631  predicted protein  36.49 
 
 
412 aa  134  2e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0827491  normal  0.813084 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00500  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 
584 aa  132  1e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05640  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10910)  36.32 
 
 
1068 aa  132  1e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.814217  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50903  predicted protein  30.06 
 
 
553 aa  130  5e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42025  predicted protein  35.24 
 
 
458 aa  123  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.067727  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3062  predicted protein  34.22 
 
 
349 aa  122  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0291461  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10956  histone acetyltransferase catalytic subunit (Eurofung)  35.29 
 
 
508 aa  121  2e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0558493  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00240  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 
940 aa  119  8e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0793418  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03160  hypothetical protein  33.04 
 
 
564 aa  113  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.283116  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82300  predicted protein  31.23 
 
 
516 aa  112  1e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284716  normal  0.810962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>