20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50419 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_50419  predicted protein  100 
 
 
345 aa  718    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49062  predicted protein  30.84 
 
 
356 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.956342  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42740  predicted protein  29.08 
 
 
290 aa  97.8  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.181506  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49068  predicted protein  27.55 
 
 
1472 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43397  predicted protein  27.84 
 
 
386 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00959094  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43507  predicted protein  25.2 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44648  predicted protein  36.42 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44608  predicted protein  28 
 
 
1115 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43508  predicted protein  28.38 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33874  predicted protein  32.65 
 
 
269 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34469  predicted protein  27.21 
 
 
464 aa  77  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48695  predicted protein  26.78 
 
 
972 aa  73.6  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43396  predicted protein  28.14 
 
 
383 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0039588  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44923  predicted protein  25.63 
 
 
723 aa  69.7  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43395  predicted protein  27.69 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0319508  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33873  predicted protein  27.8 
 
 
314 aa  62.8  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207426  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33730  predicted protein  29.32 
 
 
402 aa  60.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00194424  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48700  predicted protein  24.87 
 
 
509 aa  59.3  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.877799  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48701  predicted protein  24.2 
 
 
615 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48696  predicted protein  25.1 
 
 
853 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>