29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0505 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0505  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  213  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3187  hypothetical protein  82.24 
 
 
107 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.123063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2909  hypothetical protein  82.24 
 
 
107 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0332  hypothetical protein  69.16 
 
 
107 aa  160  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2894  hypothetical protein  69.16 
 
 
107 aa  155  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0388565  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1468  hypothetical protein  67.92 
 
 
108 aa  153  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3859  hypothetical protein  67.29 
 
 
107 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2355  hypothetical protein  50.47 
 
 
107 aa  110  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1523  hypothetical protein  49.44 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0875  hypothetical protein  47.19 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.223347  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2587  hypothetical protein  29.09 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  30.21 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3248  hypothetical protein  25 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561356  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  28.87 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  24.21 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0294  hypothetical protein  25.51 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12240  hypothetical protein  22.77 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0646  hypothetical protein  23.4 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000149489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1893  hypothetical protein  25.51 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.546257  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1152  hypothetical protein  24.42 
 
 
87 aa  43.5  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66875  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  26.32 
 
 
309 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4899  ATP synthase B chain [imported], putative  25.25 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0826  hypothetical protein  20.39 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0391  Poly granule associated  27.27 
 
 
230 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3668  hypothetical protein  30 
 
 
126 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5147  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaF  24.24 
 
 
257 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1004  hypothetical protein  23.53 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0131469 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  23.23 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0164  hypothetical protein  28.12 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.212384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>