16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2355 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2355  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  204  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0332  hypothetical protein  58.88 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2894  hypothetical protein  58.88 
 
 
107 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0388565  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1468  hypothetical protein  54.37 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3859  hypothetical protein  53.27 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2909  hypothetical protein  49.53 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3187  hypothetical protein  49.53 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.123063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0505  hypothetical protein  50.47 
 
 
108 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1523  hypothetical protein  51.69 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0875  hypothetical protein  49.44 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.223347  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4899  ATP synthase B chain [imported], putative  27.55 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0294  hypothetical protein  27.55 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2562  hypothetical protein  31.87 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1152  hypothetical protein  23.26 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2587  hypothetical protein  24.77 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1004  hypothetical protein  19.57 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0131469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>