32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_27630 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_27630  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  100 
 
 
106 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  decreased coverage  0.00161051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27640  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  88.57 
 
 
106 aa  190  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127306  decreased coverage  0.00158217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01623  RebB protein  66 
 
 
106 aa  134  3e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6979  hypothetical protein  51 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794643  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1212  hypothetical protein  50.5 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1239  hypothetical protein  51 
 
 
122 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164758  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2097  RebB protein  50 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1238  hypothetical protein  46.46 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308563  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1211  hypothetical protein  46.46 
 
 
110 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6978  hypothetical protein  46.46 
 
 
110 aa  87  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569819  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3151  RebB protein  50 
 
 
98 aa  86.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3150  RebB protein  51.11 
 
 
92 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2098  RebA protein  50 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0527054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3149  RebB protein  50 
 
 
88 aa  82  2e-15  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2096  RebB protein  48.84 
 
 
96 aa  80.5  7e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.887295  normal  0.0193954 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6980  hypothetical protein  51.43 
 
 
107 aa  73.2  1e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2099  RebB protein  43.02 
 
 
90 aa  72.4  2e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.5081  normal  0.0549517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1240  hypothetical protein  49.3 
 
 
107 aa  72  3e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430175  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1213  hypothetical protein  47.89 
 
 
107 aa  71.2  4e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3004  RebB protein  52.94 
 
 
84 aa  69.3  2e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000250436 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0261  putative RebB protein  49.25 
 
 
73 aa  68.6  3e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.38666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0274  putative RebB protein  49.25 
 
 
73 aa  68.2  4e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3360  putative RebB protein  49.25 
 
 
73 aa  68.2  4e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2104  putative RebB protein  49.25 
 
 
73 aa  68.2  4e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0458  RebB protein  49.25 
 
 
73 aa  68.2  4e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2988  putative RebB protein  49.25 
 
 
73 aa  68.2  4e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.898476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3319  RebB protein, putative  49.25 
 
 
73 aa  68.2  4e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3148  RebB protein  40.7 
 
 
88 aa  60.5  7e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6983  hypothetical protein  40.85 
 
 
126 aa  51.2  5e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0794  hypothetical protein  37.18 
 
 
118 aa  48.9  2e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1243  hypothetical protein  38.03 
 
 
101 aa  48.5  3e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317441  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1216  hypothetical protein  38.03 
 
 
105 aa  48.5  3e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>